More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1748 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  58.94 
 
 
668 aa  822    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1610  type II secretion system protein E  56.49 
 
 
673 aa  802    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  57.93 
 
 
670 aa  822    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1636  type II secretion system protein E  56.35 
 
 
673 aa  801    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2071  ATPase  54.89 
 
 
666 aa  775    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4182  type II secretion system protein E  56.26 
 
 
676 aa  801    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1748  type II secretion system protein E  100 
 
 
723 aa  1485    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  58.95 
 
 
670 aa  835    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00191  general secretion pathway protein E  51.42 
 
 
638 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2264  type II secretion system protein E  39.37 
 
 
769 aa  492  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06911  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like protein  49.29 
 
 
568 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1189  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like  49.88 
 
 
594 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  43.43 
 
 
568 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.51 
 
 
568 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.31 
 
 
568 aa  389  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.23 
 
 
568 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  43.28 
 
 
568 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  38.56 
 
 
556 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  43.63 
 
 
871 aa  389  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.31 
 
 
568 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.31 
 
 
571 aa  385  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.03 
 
 
568 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  45.54 
 
 
610 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  41.25 
 
 
787 aa  382  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  42.71 
 
 
566 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.13 
 
 
572 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  37.33 
 
 
568 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.03 
 
 
568 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  41.27 
 
 
558 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.89 
 
 
563 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.89 
 
 
568 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  45.28 
 
 
563 aa  378  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  46.2 
 
 
568 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  38.72 
 
 
557 aa  378  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  39.04 
 
 
557 aa  378  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  40.86 
 
 
553 aa  375  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  40.29 
 
 
885 aa  375  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  37.22 
 
 
577 aa  373  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.92 
 
 
571 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  39.09 
 
 
599 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.81 
 
 
568 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  39.09 
 
 
599 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  39.09 
 
 
599 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  38.31 
 
 
603 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  40.04 
 
 
570 aa  365  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  47.54 
 
 
561 aa  364  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  41.55 
 
 
571 aa  364  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  38.19 
 
 
564 aa  363  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  42.94 
 
 
520 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  38.76 
 
 
553 aa  363  8e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  47.33 
 
 
727 aa  363  9e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  41.92 
 
 
553 aa  362  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  44.16 
 
 
499 aa  361  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  38.97 
 
 
888 aa  360  6e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  40.4 
 
 
568 aa  360  6e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  46.27 
 
 
573 aa  360  7e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  45.81 
 
 
561 aa  357  5e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  43.8 
 
 
561 aa  357  5e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  42.92 
 
 
494 aa  356  1e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  40.52 
 
 
558 aa  356  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.68 
 
 
549 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  41.43 
 
 
503 aa  355  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  44.67 
 
 
567 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  41.16 
 
 
571 aa  354  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  42.71 
 
 
494 aa  353  5e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  41.23 
 
 
560 aa  353  7e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  41.75 
 
 
514 aa  352  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  46.7 
 
 
567 aa  352  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  41.88 
 
 
520 aa  352  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  45.04 
 
 
561 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  41.67 
 
 
500 aa  352  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  44.74 
 
 
573 aa  352  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0639  type II secretion system protein E  41.97 
 
 
571 aa  350  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  41.04 
 
 
891 aa  350  4e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  43.44 
 
 
493 aa  350  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  39.43 
 
 
577 aa  350  5e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  43.44 
 
 
493 aa  350  5e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  43.44 
 
 
493 aa  350  5e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  44.81 
 
 
518 aa  350  5e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  43.18 
 
 
564 aa  350  6e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  40.4 
 
 
552 aa  350  6e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  41.06 
 
 
501 aa  350  6e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  39.92 
 
 
567 aa  350  8e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.56 
 
 
578 aa  349  9e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.03 
 
 
565 aa  349  9e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  44.37 
 
 
514 aa  349  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  43.23 
 
 
493 aa  348  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  38.67 
 
 
573 aa  348  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  45.06 
 
 
471 aa  348  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  43.23 
 
 
493 aa  348  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  43.48 
 
 
521 aa  347  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2370  type IV pilus assembly protein, PilB  38.72 
 
 
571 aa  347  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.881077  normal  0.0893992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.17 
 
 
577 aa  348  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3859  type II secretion system protein E  44.8 
 
 
568 aa  348  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  40 
 
 
559 aa  347  4e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  43.25 
 
 
521 aa  347  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  43.25 
 
 
521 aa  347  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1175  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.46 
 
 
571 aa  347  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  45.23 
 
 
503 aa  347  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  45.24 
 
 
520 aa  346  7e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>