72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2222 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  100 
 
 		 300 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  47.8 
 
 		 302 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  34.34 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  32.66 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  38.1 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  32.28 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  39.19 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  33.11 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  30.66 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  33.56 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  29.39 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  30.77 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  29.72 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  28.04 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  34.85 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  33.57 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  56.86 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  27.47 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0839  UspA domain protein  28.27 
 
 		 282 aa  52.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  21.99 
 
 		 140 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  30.2 
 
 		 282 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  32.33 
 
 		 153 aa  50.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.87 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  43.18 
 
 		 160 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  26.47 
 
 		 162 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  27.7 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  27.74 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  33.57 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4264  UspA domain protein  29.93 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0292657  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  28.87 
 
 		 131 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  32.67 
 
 		 174 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 141 aa  46.6  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  29.45 
 
 		 143 aa  45.8  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  29.45 
 
 		 143 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  28.97 
 
 		 143 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  21.15 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  45.65 
 
 		 154 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  28.86 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  28.12 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  31.72 
 
 		 147 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  26.32 
 
 		 145 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  28.24 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  23.73 
 
 		 140 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  35.42 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  27.31 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  30.88 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  28.8 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  27.34 
 
 		 150 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.93 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  30.37 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  25 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 		 449 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  25.75 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  32.64 
 
 		 143 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0315  UspA domain-containing protein  31.11 
 
 		 146 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 149 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  43.4 
 
 		 136 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0709  UspA domain protein  34.48 
 
 		 140 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  22.96 
 
 		 285 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  26.79 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  25.37 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  35.8 
 
 		 130 aa  42.7  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  36.84 
 
 		 142 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  28.37 
 
 		 130 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 324 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>