200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1083 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1083  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
400 aa  738    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8490  major facilitator superfamily permease  51.79 
 
 
396 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249724  normal  0.30566 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  48.73 
 
 
413 aa  282  9e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8344  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 
412 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1460  major facilitator transporter  36.91 
 
 
393 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3369  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 
436 aa  140  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
381 aa  136  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  35.22 
 
 
384 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  31.93 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
385 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
387 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
386 aa  119  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  32.41 
 
 
398 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  31.39 
 
 
396 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
388 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  32.59 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  30.96 
 
 
403 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  32.44 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  32.44 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  34.25 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  33.33 
 
 
385 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
402 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  33.15 
 
 
388 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  27.03 
 
 
405 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  33.98 
 
 
377 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  33.16 
 
 
383 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  30.2 
 
 
382 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  28.87 
 
 
384 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
391 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  29.82 
 
 
396 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
387 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0226  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 
421 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.550832  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1109  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
389 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0848827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  30.79 
 
 
383 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5894  major facilitator transporter  34.1 
 
 
389 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 
403 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 
387 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
407 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3207  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
389 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  28.61 
 
 
441 aa  96.7  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
408 aa  96.7  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
396 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0408  major facilitator transporter  28.98 
 
 
443 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  26.63 
 
 
397 aa  95.5  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0228  putative transport protein  32.29 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
385 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  31.95 
 
 
384 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  30.1 
 
 
447 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  32.29 
 
 
378 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  32.29 
 
 
378 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  32.29 
 
 
378 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  32.29 
 
 
378 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1229  putative transporter  32.29 
 
 
378 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  26.22 
 
 
397 aa  93.6  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3213  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 
390 aa  93.6  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00200336  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 
392 aa  92.8  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3382  major facilitator transporter  29.75 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  35.25 
 
 
392 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1735  major facilitator superfamily permease  32.03 
 
 
378 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
398 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  31.28 
 
 
383 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3420  major facilitator transporter  32.06 
 
 
414 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00336809  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  31.01 
 
 
383 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 
386 aa  90.1  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  29.95 
 
 
414 aa  89.7  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  32.88 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  31.02 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19000  sugar phosphate permease  29.07 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.874746  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2067  putative transport protein (permease)  30.6 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  27.59 
 
 
391 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  31.17 
 
 
386 aa  88.2  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4953  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 
465 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  28.29 
 
 
387 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  28.29 
 
 
387 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  23.46 
 
 
386 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  28.35 
 
 
428 aa  86.7  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3896  hypothetical protein  31.43 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.446184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  28.97 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  29.87 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  27.73 
 
 
387 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  27.3 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  28.35 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3065  MFS family transporter  31.55 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1953  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
411 aa  82.8  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0177432  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  30.75 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  30.75 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  30.75 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
435 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
379 aa  82.8  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3238  major facilitator transporter  30.93 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1030  major facilitator transporter  28.49 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0160  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.165984 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>