More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1386 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  428  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  26.75 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  24.57 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  26.75 
 
 		 226 aa  85.1  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  25.21 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  31.48 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  33.85 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  35.86 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  31.75 
 
 		 492 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  32.31 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  32.31 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  32.31 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  25 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3486  CBS domain-containing protein  29.8 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000172668 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  35.43 
 
 		 300 aa  71.2  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  33.59 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  33.6 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  29.46 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  31.3 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  30.37 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  32.8 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  32.47 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1197  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.63 
 
 		 491 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  28.17 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  24.56 
 
 		 476 aa  65.1  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  30.72 
 
 		 162 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.07 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  34.09 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  31.75 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  29.17 
 
 		 513 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  34.35 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.01 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  25.56 
 
 		 145 aa  62  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  25.95 
 
 		 385 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  30.6 
 
 		 503 aa  61.6  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  29.79 
 
 		 137 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  35.61 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  27.86 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  30.23 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  26.15 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  30.89 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 141 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 		 139 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  28.38 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  23.62 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  35.38 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3527  CBS domain-containing protein  27.34 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 1344 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  31.08 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  24.5 
 
 		 769 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  29.92 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  32.03 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  31.25 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  23.62 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.92 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.757104  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  31.08 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  33.59 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  34.85 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.38 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  31.62 
 
 		 883 aa  60.1  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  28.8 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6330  CBS domain containing protein  30.77 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  28.91 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  27.27 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  29.77 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  32.33 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  34.09 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  27.32 
 
 		 384 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  31.54 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  26.35 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  28.8 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  28.08 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  28.46 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  30.4 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  27.34 
 
 		 368 aa  58.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0831  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  24.02 
 
 		 400 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  25.4 
 
 		 513 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 873 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>