More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1813 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
182 aa  362  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  86.3 
 
 
158 aa  254  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  82.52 
 
 
143 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  72.48 
 
 
149 aa  220  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  71.92 
 
 
147 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  71.53 
 
 
150 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  76.47 
 
 
136 aa  210  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  71.14 
 
 
158 aa  210  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  63.98 
 
 
156 aa  205  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  69.33 
 
 
151 aa  205  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  65.56 
 
 
168 aa  203  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  67.12 
 
 
165 aa  201  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  68.31 
 
 
149 aa  198  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  56.64 
 
 
150 aa  168  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  64.08 
 
 
161 aa  168  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  57.34 
 
 
156 aa  160  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  60.56 
 
 
166 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  60.56 
 
 
166 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  57.86 
 
 
152 aa  158  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 
156 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 
159 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  57.75 
 
 
160 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  47.22 
 
 
144 aa  142  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  48.23 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  46.98 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  44.16 
 
 
152 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
152 aa  117  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  42.36 
 
 
152 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  41.07 
 
 
167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  42.41 
 
 
156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  46.26 
 
 
175 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
153 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
153 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
170 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
170 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  37.34 
 
 
170 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 
153 aa  99  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  33.57 
 
 
144 aa  98.6  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 
155 aa  97.8  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  40.25 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 
167 aa  95.5  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  36.77 
 
 
164 aa  94  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
153 aa  94  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 
153 aa  93.6  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
145 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  42.15 
 
 
165 aa  92  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
164 aa  91.3  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
150 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  34.03 
 
 
164 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
144 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 
164 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 
149 aa  89.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 
164 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 
164 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  38.16 
 
 
167 aa  89.4  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  89.4  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  38.82 
 
 
167 aa  89  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  35.15 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  38.16 
 
 
167 aa  88.6  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  39.57 
 
 
167 aa  89  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
179 aa  88.6  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 
156 aa  88.6  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.16 
 
 
153 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
153 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 
167 aa  88.2  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 
151 aa  88.2  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
165 aa  87.8  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 
166 aa  87.8  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 
168 aa  87.4  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 
168 aa  87.4  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 
168 aa  87.4  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 
165 aa  87.4  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 
168 aa  87.4  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 
162 aa  87.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  38.85 
 
 
168 aa  87.4  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>