More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2591 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  100 
 
 
687 aa  1388    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  44.67 
 
 
683 aa  514  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03722  outer membrane hemin receptor signal peptide protein  27.72 
 
 
741 aa  146  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000281288  normal  0.0836882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.13 
 
 
767 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4772  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.11 
 
 
769 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784759  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0347  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  25.54 
 
 
759 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1781  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.56 
 
 
769 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0440  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  25.56 
 
 
764 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3338  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.49 
 
 
755 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.275973  decreased coverage  0.000566863 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1826  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.41 
 
 
718 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0529347  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2089  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  25.39 
 
 
767 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329074  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1115  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  25.39 
 
 
767 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0824  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor family protein  25.39 
 
 
767 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.09 
 
 
730 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 
760 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 
672 aa  118  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.07 
 
 
755 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.89 
 
 
757 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.74 
 
 
755 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.74 
 
 
755 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 
768 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  22.87 
 
 
764 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  25.1 
 
 
694 aa  109  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  24.96 
 
 
676 aa  108  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  23.1 
 
 
676 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  23.26 
 
 
676 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.26 
 
 
676 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  22.88 
 
 
722 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  21.87 
 
 
859 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  24.72 
 
 
660 aa  101  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  24.39 
 
 
660 aa  102  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.51 
 
 
661 aa  101  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 
685 aa  99  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 
682 aa  98.6  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 
824 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  25.25 
 
 
653 aa  98.2  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  22.51 
 
 
715 aa  94.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  21.54 
 
 
693 aa  94.7  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  22.36 
 
 
640 aa  94  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  22.7 
 
 
633 aa  94  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1746  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 
668 aa  94  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  25 
 
 
685 aa  93.2  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.89 
 
 
1023 aa  93.2  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  21.09 
 
 
697 aa  93.2  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  25.04 
 
 
687 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 
801 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  24.7 
 
 
687 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 
680 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 
698 aa  91.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 
727 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6321  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 
732 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  23.65 
 
 
695 aa  89  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 
698 aa  88.2  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  20.15 
 
 
698 aa  87.8  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0460  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  22.02 
 
 
731 aa  87.8  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.39 
 
 
728 aa  87.4  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2139  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  27.8 
 
 
766 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 
685 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 
759 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 
682 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 
699 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  29.28 
 
 
699 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  24.27 
 
 
572 aa  84.3  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 
657 aa  84.3  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  21.26 
 
 
775 aa  84  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 
698 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 
698 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  22.08 
 
 
713 aa  83.2  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 
698 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 
634 aa  82.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 
648 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0966  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.88 
 
 
696 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.47 
 
 
663 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 
663 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  32.47 
 
 
659 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  32.47 
 
 
663 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.47 
 
 
663 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  25 
 
 
694 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.47 
 
 
663 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.47 
 
 
663 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3638  TonB-dependent receptor, putative  21.79 
 
 
739 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240989 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3338  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.66 
 
 
696 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000719833  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  30.74 
 
 
686 aa  81.6  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  24.05 
 
 
764 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.27 
 
 
619 aa  81.3  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  25.57 
 
 
616 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 
685 aa  80.9  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  31.37 
 
 
656 aa  80.9  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 
677 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 
624 aa  80.9  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  34.27 
 
 
652 aa  80.9  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 
661 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 
693 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 
705 aa  79.7  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 
692 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  23.68 
 
 
724 aa  80.1  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 
742 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  24.74 
 
 
653 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.35 
 
 
635 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 
677 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>