More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0429 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0414  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  98.83 
 
 		 599 aa  1208    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0429  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  100 
 
 		 599 aa  1219    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000753896  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0154  recombination factor protein RarA  47.17 
 
 		 410 aa  375  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0144  recombination factor protein RarA  49.1 
 
 		 378 aa  357  2.9999999999999997e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  43.4 
 
 		 434 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  43.13 
 
 		 443 aa  345  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  43.47 
 
 		 434 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  43.97 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1323  recombination factor protein RarA  43.2 
 
 		 411 aa  336  5.999999999999999e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0587994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  42.32 
 
 		 447 aa  333  5e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  41.81 
 
 		 432 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  42.22 
 
 		 426 aa  332  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  43.63 
 
 		 446 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  42.86 
 
 		 453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  45.18 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  45.18 
 
 		 437 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  45.18 
 
 		 437 aa  326  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  42.79 
 
 		 457 aa  325  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  41.19 
 
 		 441 aa  325  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  40.95 
 
 		 435 aa  325  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  42.62 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  40.53 
 
 		 440 aa  324  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  41.88 
 
 		 425 aa  323  5e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  42.49 
 
 		 434 aa  323  6e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  39.48 
 
 		 435 aa  323  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  42.99 
 
 		 431 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  42.66 
 
 		 449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  39.57 
 
 		 448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  43.5 
 
 		 419 aa  319  7.999999999999999e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  42.02 
 
 		 457 aa  319  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  42.25 
 
 		 423 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  39.44 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  42.38 
 
 		 420 aa  318  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  41.25 
 
 		 430 aa  317  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  38.72 
 
 		 440 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  41.11 
 
 		 446 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  42.82 
 
 		 445 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  42.12 
 
 		 441 aa  310  6.999999999999999e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  40.61 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  41.09 
 
 		 450 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  42.25 
 
 		 423 aa  307  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  45.02 
 
 		 444 aa  308  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  39.34 
 
 		 447 aa  307  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  41.01 
 
 		 454 aa  306  6e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  40.38 
 
 		 457 aa  306  7e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  39.95 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  39.04 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  42.54 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  38.19 
 
 		 463 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  38.82 
 
 		 445 aa  305  2.0000000000000002e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  41.25 
 
 		 432 aa  304  3.0000000000000004e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  42.65 
 
 		 432 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1564  recombination factor protein RarA  39.86 
 
 		 404 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  40.1 
 
 		 431 aa  302  9e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0979  AAA ATPase central domain protein  44.17 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  39.23 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  38.48 
 
 		 739 aa  299  9e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  39.86 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  39.52 
 
 		 439 aa  298  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  39.23 
 
 		 442 aa  297  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2552  recombination factor protein RarA  38.94 
 
 		 435 aa  296  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  38.23 
 
 		 438 aa  296  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  37.99 
 
 		 441 aa  296  8e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  39 
 
 		 442 aa  296  8e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  39.32 
 
 		 435 aa  296  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  37.62 
 
 		 447 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1853  recombination factor protein RarA  40.44 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  40.79 
 
 		 408 aa  295  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  37.35 
 
 		 731 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  40.33 
 
 		 435 aa  294  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  40.29 
 
 		 447 aa  294  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  37.33 
 
 		 458 aa  294  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  38.9 
 
 		 432 aa  294  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  38.14 
 
 		 437 aa  293  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  38.74 
 
 		 437 aa  293  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0549  AAA ATPase central domain protein  37.68 
 
 		 442 aa  293  7e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.124286  hitchhiker  0.0000609256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2146  recombination factor protein RarA  38.94 
 
 		 449 aa  293  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0601218  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0379  ATPase, AAA family  37.68 
 
 		 442 aa  293  7e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  38.98 
 
 		 447 aa  293  8e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  39 
 
 		 427 aa  292  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  39.67 
 
 		 435 aa  292  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1043  recombination factor protein RarA  38.26 
 
 		 437 aa  292  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  39.47 
 
 		 726 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  38.9 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  37.9 
 
 		 437 aa  291  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  39.23 
 
 		 428 aa  291  3e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  38.11 
 
 		 453 aa  291  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  39.02 
 
 		 443 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  40.81 
 
 		 505 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  38.63 
 
 		 440 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  38.35 
 
 		 437 aa  290  7e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0694  recombination factor protein RarA  39.09 
 
 		 445 aa  290  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1401  recombination factor protein RarA  40.52 
 
 		 411 aa  289  9e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  38.37 
 
 		 438 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  38.41 
 
 		 436 aa  289  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  40.1 
 
 		 451 aa  289  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  38.13 
 
 		 441 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  40.19 
 
 		 435 aa  288  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  40.89 
 
 		 427 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1761  recombination factor protein RarA  41.11 
 
 		 452 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>