More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0029 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  70.81 
 
 		 478 aa  638    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  100 
 
 		 488 aa  946    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  63.64 
 
 		 482 aa  595  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  49.16 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  47.92 
 
 		 476 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  26.02 
 
 		 709 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  25.94 
 
 		 704 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  27.09 
 
 		 693 aa  134  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.798545 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  25.37 
 
 		 699 aa  124  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  27.66 
 
 		 724 aa  124  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  25.69 
 
 		 674 aa  123  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  27.66 
 
 		 643 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  23.4 
 
 		 680 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.811341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  26.5 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  27.25 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  26.86 
 
 		 482 aa  114  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  24.74 
 
 		 692 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  25.33 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  27.23 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  26.58 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  26.29 
 
 		 482 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  25.11 
 
 		 460 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  25.65 
 
 		 556 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  24.18 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  25 
 
 		 659 aa  101  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  25.11 
 
 		 587 aa  101  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  23.92 
 
 		 500 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  26.43 
 
 		 506 aa  97.8  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  24.8 
 
 		 479 aa  97.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  26.57 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  27.17 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  25.28 
 
 		 496 aa  94.7  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  22.93 
 
 		 449 aa  93.6  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  28.57 
 
 		 477 aa  93.2  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  26.61 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  27.91 
 
 		 477 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  28.14 
 
 		 477 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  28.57 
 
 		 479 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  27.91 
 
 		 477 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  25.15 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  28.14 
 
 		 477 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  28.57 
 
 		 479 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  28.57 
 
 		 479 aa  91.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1786  Na+/solute symporter  28.12 
 
 		 483 aa  91.3  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483787  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26.02 
 
 		 492 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  26.79 
 
 		 510 aa  90.1  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  23.91 
 
 		 479 aa  90.1  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.86 
 
 		 492 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  26.36 
 
 		 486 aa  89.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  29.57 
 
 		 598 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  26.17 
 
 		 492 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  27.99 
 
 		 477 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  24.26 
 
 		 479 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.87 
 
 		 487 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.93 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  26.87 
 
 		 493 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.95 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  26.17 
 
 		 493 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.12 
 
 		 523 aa  89.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  26.17 
 
 		 493 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  25 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  24.95 
 
 		 492 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.93 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  26.87 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  26.87 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.93 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.17 
 
 		 492 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  28.41 
 
 		 479 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.79 
 
 		 492 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  28.41 
 
 		 479 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  23.92 
 
 		 520 aa  88.2  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  26.56 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  27.63 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  24.55 
 
 		 554 aa  87.8  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  27.39 
 
 		 525 aa  87.8  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  23.45 
 
 		 658 aa  87.8  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.24 
 
 		 492 aa  87  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  23.69 
 
 		 478 aa  87  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  24.77 
 
 		 474 aa  86.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  25.22 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  24.82 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.97 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  26.29 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.59 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  25.7 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  21.41 
 
 		 668 aa  84.3  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.18 
 
 		 565 aa  84.3  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.67 
 
 		 522 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.88 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.68 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  25.93 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  25.97 
 
 		 507 aa  83.2  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  21.96 
 
 		 668 aa  83.2  0.000000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  25.36 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  26.65 
 
 		 489 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  24.79 
 
 		 485 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  25.29 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  25.83 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  28.35 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  25.83 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>