More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11747 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  100 
 
 
539 aa  1107    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  40.9 
 
 
440 aa  230  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  35.06 
 
 
461 aa  210  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  39.39 
 
 
464 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  34.48 
 
 
446 aa  203  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  34.38 
 
 
463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  34.37 
 
 
455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.08 
 
 
484 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  35.04 
 
 
431 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  33.11 
 
 
437 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  31.27 
 
 
460 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  34.05 
 
 
456 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.45 
 
 
551 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  31.78 
 
 
462 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  31.51 
 
 
533 aa  154  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  29.95 
 
 
519 aa  144  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  32.54 
 
 
567 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  28.47 
 
 
691 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  28.23 
 
 
691 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  27.99 
 
 
691 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  27.99 
 
 
691 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  29.78 
 
 
530 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  29.45 
 
 
513 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  27.51 
 
 
691 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  27.47 
 
 
529 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.13 
 
 
601 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  29.01 
 
 
525 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  29.41 
 
 
477 aa  127  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  29.67 
 
 
635 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  28.28 
 
 
650 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  29.11 
 
 
694 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  27.03 
 
 
803 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  28.74 
 
 
447 aa  123  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  29.17 
 
 
694 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.97 
 
 
681 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  27.79 
 
 
691 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.21 
 
 
487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  30.88 
 
 
533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  27.46 
 
 
633 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  28.45 
 
 
544 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.23 
 
 
497 aa  120  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  27.85 
 
 
530 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  29.51 
 
 
694 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  29.24 
 
 
485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  27.54 
 
 
655 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  27.92 
 
 
600 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  28.49 
 
 
520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  29.28 
 
 
620 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  27.89 
 
 
530 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.49 
 
 
595 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  28.12 
 
 
485 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  29.69 
 
 
533 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  29.69 
 
 
533 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  27.3 
 
 
526 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  27.25 
 
 
353 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  29.69 
 
 
533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  26.5 
 
 
523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  29.51 
 
 
560 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.22 
 
 
514 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  29.63 
 
 
389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.36 
 
 
480 aa  114  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.95 
 
 
407 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  27.27 
 
 
637 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  29.21 
 
 
385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  27.84 
 
 
485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  27.25 
 
 
485 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  28.48 
 
 
485 aa  112  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.95 
 
 
385 aa  112  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  26.24 
 
 
485 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  25.51 
 
 
610 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  27.58 
 
 
485 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  27.84 
 
 
485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  29.54 
 
 
566 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  27.91 
 
 
466 aa  111  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  27.54 
 
 
485 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  27.54 
 
 
485 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.16 
 
 
407 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.21 
 
 
385 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.64 
 
 
388 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  29.76 
 
 
375 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.21 
 
 
385 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.75 
 
 
508 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25.96 
 
 
485 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  29.58 
 
 
430 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  29.97 
 
 
566 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  27.03 
 
 
485 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  30.08 
 
 
658 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  30.12 
 
 
531 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.18 
 
 
389 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.56 
 
 
401 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  28.6 
 
 
717 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  27.24 
 
 
388 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  27.24 
 
 
388 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.24 
 
 
388 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  27.24 
 
 
388 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  27.32 
 
 
405 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  29.3 
 
 
386 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  27.06 
 
 
405 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  26.98 
 
 
778 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  26.52 
 
 
720 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>