More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1893 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  100 
 
 		 258 aa  517  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  68.67 
 
 		 260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  67.74 
 
 		 258 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  67.74 
 
 		 258 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  65.86 
 
 		 261 aa  341  8e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  65.08 
 
 		 260 aa  338  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  66.13 
 
 		 270 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  52.05 
 
 		 351 aa  254  9e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 263 aa  248  8e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  50 
 
 		 293 aa  247  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  45.67 
 
 		 265 aa  246  4e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  49.01 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  47.58 
 
 		 302 aa  239  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  48.39 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  48.39 
 
 		 257 aa  239  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 353 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  48.81 
 
 		 297 aa  236  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  45.85 
 
 		 349 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  48.41 
 
 		 277 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 265 aa  235  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  46.37 
 
 		 327 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  45.45 
 
 		 367 aa  231  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  44.88 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  46.37 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  47.24 
 
 		 266 aa  225  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  46.15 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  42.46 
 
 		 260 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  44.44 
 
 		 260 aa  215  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  43.37 
 
 		 272 aa  214  9e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.06 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  42.06 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  43.25 
 
 		 263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  43.24 
 
 		 265 aa  211  9e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  43.72 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  42 
 
 		 256 aa  208  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  44.13 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3414  ABC transporter component  46.28 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0599  ABC transporter related  44.58 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  41.43 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1783  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  40.08 
 
 		 264 aa  204  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0473168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1975  ABC transporter related  45.06 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  42.46 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2268  ABC transporter related  45.45 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 256 aa  201  7e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4649  ABC transporter related  42.4 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.6 
 
 		 256 aa  201  8e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  44.35 
 
 		 603 aa  201  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4426  ABC transporter related  43.82 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0334  ABC transporter related  47.49 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3931  ABC transporter related  43.41 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  42 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  44.98 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  43.2 
 
 		 555 aa  199  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  41.13 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  38.67 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3819  ABC transporter related  38.55 
 
 		 262 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0171499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  41.6 
 
 		 250 aa  198  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  42.34 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  40.96 
 
 		 264 aa  198  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3499  ABC transporter related  42.74 
 
 		 616 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.44118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  41.94 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  40.24 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  41.37 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  40 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  38.74 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  40.71 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  44.14 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  38.25 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3752  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 		 255 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3830  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 		 255 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  42.46 
 
 		 252 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 		 255 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3763  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 		 255 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3932  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 		 255 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  38.19 
 
 		 258 aa  194  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 257 aa  194  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  41.41 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  38.87 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  39.45 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  40.62 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0262  ABC transporter related  40.08 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  40.4 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  43.43 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1672  ABC transporter related  42.06 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  39.84 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  39.37 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  41.47 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  38.55 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  40.96 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  39.29 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  40.32 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>