More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0610 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  100 
 
 		 599 aa  1182    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  37.9 
 
 		 595 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  33.46 
 
 		 537 aa  250  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  33.45 
 
 		 550 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 538 aa  243  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  30.96 
 
 		 600 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 528 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 528 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0540  MscS Mechanosensitive ion channel  30.66 
 
 		 582 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  37.65 
 
 		 656 aa  190  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  42.29 
 
 		 350 aa  182  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  42.55 
 
 		 394 aa  174  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  41.09 
 
 		 344 aa  169  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  44.27 
 
 		 773 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 335 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  30.32 
 
 		 569 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 569 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  31.27 
 
 		 505 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2274  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 586 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 283 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 356 aa  158  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 294 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  32.99 
 
 		 442 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  38.82 
 
 		 367 aa  153  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 321 aa  151  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  36.25 
 
 		 299 aa  151  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  39.63 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 		 342 aa  150  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  33.78 
 
 		 568 aa  150  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  37.61 
 
 		 342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  43.78 
 
 		 304 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  31.09 
 
 		 285 aa  148  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 299 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  35.78 
 
 		 334 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  38.42 
 
 		 876 aa  146  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 337 aa  146  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  37.93 
 
 		 767 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  34 
 
 		 289 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  35.78 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  36.17 
 
 		 337 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  35.51 
 
 		 336 aa  144  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  29.33 
 
 		 293 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  29.6 
 
 		 293 aa  144  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  29.6 
 
 		 293 aa  144  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  29.6 
 
 		 293 aa  143  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  29.6 
 
 		 293 aa  144  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  29.6 
 
 		 293 aa  144  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  29.57 
 
 		 293 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5270  MscS mechanosensitive ion channel  29.24 
 
 		 285 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  36.67 
 
 		 759 aa  141  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  32.06 
 
 		 455 aa  140  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 		 787 aa  140  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 		 288 aa  140  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  39.06 
 
 		 879 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  33.04 
 
 		 458 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  33.04 
 
 		 455 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 327 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 327 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 327 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  35.19 
 
 		 787 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  32.74 
 
 		 293 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  32.74 
 
 		 293 aa  137  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  34.76 
 
 		 787 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  32.33 
 
 		 762 aa  135  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  36.53 
 
 		 766 aa  134  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  31.39 
 
 		 771 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  31.05 
 
 		 735 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  37.93 
 
 		 372 aa  134  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  31.45 
 
 		 735 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  34.4 
 
 		 753 aa  134  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  31.52 
 
 		 549 aa  134  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 718 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  34.42 
 
 		 266 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2189  MscS mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 		 821 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5311  MscS mechanosensitive ion channel  29.89 
 
 		 858 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021896 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2784  MscS mechanosensitive ion channel  35.95 
 
 		 801 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 370 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 		 325 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  32.41 
 
 		 336 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4463  MscS mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 		 822 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141403  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  29.95 
 
 		 718 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3624  MscS mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 		 822 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3903  MscS mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 		 822 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4049  MscS Mechanosensitive ion channel  33.85 
 
 		 650 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 864 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  30.69 
 
 		 871 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  34.1 
 
 		 792 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4680  MscS mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 837 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4450  MscS mechanosensitive ion channel  35.12 
 
 		 334 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  34.38 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 719 aa  128  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 693 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  32.31 
 
 		 756 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0128  MscS mechanosensitive ion channel  33.6 
 
 		 275 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  33.16 
 
 		 717 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4901  MscS Mechanosensitive ion channel  33.78 
 
 		 301 aa  127  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 717 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1224  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 838 aa  127  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  33.16 
 
 		 715 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>