More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0201 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
398 aa  783    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  52.98 
 
 
425 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  51.71 
 
 
419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  32.49 
 
 
366 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
366 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
396 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  39.9 
 
 
364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  32.6 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  39.01 
 
 
443 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 
394 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  48.08 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  26.49 
 
 
321 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  39.77 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
409 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
404 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
353 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  42.01 
 
 
370 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  35.82 
 
 
385 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
361 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
409 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  38.05 
 
 
369 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  34.41 
 
 
369 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 
375 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 
379 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  36.17 
 
 
388 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 
368 aa  100  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 
390 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
365 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  40.35 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  37.97 
 
 
654 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  28.46 
 
 
347 aa  97.4  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  24.03 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
366 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
355 aa  97.4  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.31 
 
 
375 aa  97.1  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
364 aa  97.1  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  38.86 
 
 
378 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  26.26 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  38.51 
 
 
388 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 
418 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  40.51 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  40.65 
 
 
389 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  35.88 
 
 
347 aa  93.2  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 
393 aa  93.6  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  43.45 
 
 
379 aa  93.2  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
384 aa  93.2  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1612  glycosyl transferase, group 1, putative  24.18 
 
 
368 aa  93.2  7e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.725545  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  36.27 
 
 
373 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  41.03 
 
 
371 aa  92.8  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  42.68 
 
 
394 aa  92.8  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  33.03 
 
 
371 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
396 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 
383 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  31 
 
 
416 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.77 
 
 
409 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  47.3 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  28.68 
 
 
369 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
390 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  33.78 
 
 
435 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  37.02 
 
 
382 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
426 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
414 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  40.91 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 
363 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  25.5 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
750 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 
359 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  37.87 
 
 
360 aa  90.1  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  45.53 
 
 
378 aa  89.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
390 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0200  putative glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
392 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
399 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 
367 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  31.83 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  43.92 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 
371 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  35.12 
 
 
368 aa  87  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
365 aa  86.7  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
398 aa  86.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
348 aa  86.7  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.76 
 
 
415 aa  86.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
384 aa  86.7  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  23.88 
 
 
365 aa  86.7  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  40.67 
 
 
1080 aa  86.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  37.07 
 
 
362 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 
384 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>