More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1962 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1962  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
279 aa  578  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0162659  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3720  CheR-type protein glutamate methyltransferase  55.07 
 
 
281 aa  334  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3785  MCP methyltransferase, CheR-type  57.52 
 
 
298 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2647  MCP methyltransferase, CheR-type  55.35 
 
 
277 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2588  MCP methyltransferase, CheR-type  53.01 
 
 
286 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2143  MCP methyltransferase, CheR-type  52.21 
 
 
273 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255114  hitchhiker  0.000601426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3760  MCP methyltransferase, CheR-type  51.84 
 
 
273 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2003  MCP methyltransferase, CheR-type  51.84 
 
 
273 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0541882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0170  MCP methyltransferase, CheR-type  53.21 
 
 
269 aa  294  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2107  MCP methyltransferase, CheR-type  51.84 
 
 
273 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314277  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2713  chemotaxis protein methyltransferase CheR, putative  51.84 
 
 
288 aa  291  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2446  MCP methyltransferase, CheR-type:MCP methyltransferase, CheR-type  52.26 
 
 
280 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.676059  hitchhiker  0.0010522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2804  MCP methyltransferase, CheR-type  50.94 
 
 
284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0021  MCP methyltransferase, CheR-type  50.75 
 
 
277 aa  280  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1647  protein-glutamate O-methyltransferase  53.23 
 
 
279 aa  280  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2079  MCP methyltransferase, CheR-type  50.76 
 
 
280 aa  280  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.166097 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0906  MCP methyltransferase, CheR-type  49.62 
 
 
285 aa  279  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1072  MCP methyltransferase, CheR-type  49.81 
 
 
303 aa  278  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0475353  normal  0.619503 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0916  chemotaxis protein methyltransferase  49.06 
 
 
285 aa  276  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1036  methyltransferase, CheR family  48.68 
 
 
285 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4267  methyltransferase, CheR family  48.86 
 
 
285 aa  275  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1089  CheR family methyltransferase  48.68 
 
 
285 aa  275  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0931  CheR family methyltransferase  48.68 
 
 
285 aa  275  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0899  chemotaxis protein methyltransferase  48.68 
 
 
285 aa  275  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.391368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0995  CheR family methyltransferase  48.68 
 
 
285 aa  275  8e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1162  methyltransferase, CheR family  48.68 
 
 
285 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3830  MCP methyltransferase, CheR-type  48 
 
 
279 aa  274  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.109211  normal  0.0246625 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1071  methyltransferase, CheR family  48.3 
 
 
285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2641  MCP methyltransferase, CheR-type  48.16 
 
 
280 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0696969  normal  0.649849 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3008  MCP methyltransferase, CheR-type  49.26 
 
 
284 aa  271  9e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.47371  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2258  MCP methyltransferase, CheR-type  47.49 
 
 
273 aa  265  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232236  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0391  MCP methyltransferase, CheR-type  49.07 
 
 
269 aa  264  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.329659 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9100  chemotaxis methyltransferase  46.47 
 
 
277 aa  264  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.437866  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0648  MCP methyltransferase, CheR-type  47.17 
 
 
277 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687034  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0627  MCP methyltransferase, CheR-type  47.17 
 
 
277 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5389  MCP methyltransferase, CheR-type  46.42 
 
 
281 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.087353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3995  MCP methyltransferase, CheR-type  47.37 
 
 
285 aa  262  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.318486  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1268  MCP methyltransferase, CheR-type  47.76 
 
 
269 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4781  MCP methyltransferase, CheR-type  47.21 
 
 
276 aa  258  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.735388  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4783  MCP methyltransferase CheR-type  44.4 
 
 
279 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1217  MCP methyltransferase, CheR-type  46.62 
 
 
281 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702972  normal  0.558808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1943  MCP methyltransferase, CheR-type  47.58 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.125019  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5354  MCP methyltransferase, CheR-type  45.52 
 
 
274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.510015 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1033  MCP methyltransferase, CheR-type  47.94 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3352  protein-glutamate O-methyltransferase  45.9 
 
 
269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.110859  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4209  MCP methyltransferase, CheR-type  46.04 
 
 
282 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1738  MCP methyltransferase, CheR-type  43.59 
 
 
274 aa  248  6e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.123373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1030  MCP methyltransferase, CheR-type  44.4 
 
 
275 aa  248  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3336  MCP methyltransferase, CheR-type  49.41 
 
 
277 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4246  Protein-glutamate O-methyltransferase  44.03 
 
 
274 aa  232  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127197  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2077  MCP methyltransferase, CheR-type  44.92 
 
 
277 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0541  protein-glutamate O-methyltransferase  43.7 
 
 
278 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126293  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1001  protein-glutamate O-methyltransferase  44.98 
 
 
275 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0586  Protein-glutamate O-methyltransferase  44.05 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1134  MCP methyltransferase, CheR-type  36.57 
 
 
271 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0014664  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2113  MCP methyltransferase, CheR-type  36.36 
 
 
565 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.982588  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0288  MCP methyltransferase, CheR-type  36.8 
 
 
369 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.891674  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  31.37 
 
 
837 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  34.35 
 
 
1384 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.55 
 
 
1408 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  32.18 
 
 
1010 aa  149  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  32.57 
 
 
1399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.09 
 
 
1348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1028  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.46 
 
 
1248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2564  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.7 
 
 
1089 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.58 
 
 
1361 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  32.96 
 
 
1378 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.66 
 
 
1371 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  30.34 
 
 
980 aa  143  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  32.18 
 
 
1027 aa  143  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.2 
 
 
1193 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  30.43 
 
 
853 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
1279 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  32.13 
 
 
868 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.18 
 
 
1306 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.25 
 
 
1167 aa  142  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.95 
 
 
1535 aa  142  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2162  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB  29.68 
 
 
879 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2227  MCP methyltransferase, CheR-type  32.45 
 
 
824 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1410  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.95 
 
 
1120 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.45 
 
 
1242 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.37 
 
 
993 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.11 
 
 
1158 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.19 
 
 
1380 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.05 
 
 
1407 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  33.58 
 
 
856 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  30.65 
 
 
1160 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.77 
 
 
1404 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.94 
 
 
1190 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.08 
 
 
1215 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.4 
 
 
1499 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.63 
 
 
887 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0399  MCP methyltransferase, CheR-type  29.63 
 
 
820 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.08 
 
 
1274 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.02 
 
 
1218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.58 
 
 
1453 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
1344 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  30.35 
 
 
1324 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0370  protein-glutamate O-methyltransferase  30.92 
 
 
639 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.181962  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  29.74 
 
 
1008 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>