100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5116 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5116  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 209 aa  426  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5585  Phosphoglycerate mutase  74.24 
 
 		 209 aa  284  7e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393552  normal  0.0995735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5383  phosphoglycerate mutase family protein  47.25 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4450  phosphoglycerate mutase family protein  50.65 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0965  Phosphoglycerate mutase  44.69 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3846  phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 		 194 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0304  phosphoglycerate mutase  44.32 
 
 		 222 aa  121  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.484417  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  32.4 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  29.55 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.64 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  29.55 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  29.55 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  26.55 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  28.98 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1697  alpha-ribazole phosphatase  35.9 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  40.28 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  28.36 
 
 		 259 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  29.49 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  29.41 
 
 		 189 aa  48.1  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  28.81 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  39.73 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  26.59 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  30.72 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  29.28 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  36.73 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  27.39 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  36.73 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  36.73 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.37 
 
 		 382 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4800  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 		 234 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40.26 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  26.59 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0909  Phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 		 171 aa  45.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.223074  hitchhiker  0.000993193 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  28.71 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  28.71 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 242 aa  45.1  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  43.33 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0608  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  25.62 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.67 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  42.25 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10190  fructose-2,6-bisphosphatase  30.17 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  35.17 
 
 		 391 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  26.06 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  30.71 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 258 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  23.86 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2672  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.77 
 
 		 152 aa  42.4  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  30.64 
 
 		 200 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 		 245 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1516  phosphoglycerate mutase  28.41 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.481804 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  35.62 
 
 		 152 aa  42  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 		 220 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0137  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  27.11 
 
 		 245 aa  41.6  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0349  Phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 227 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  29.41 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1676  Phosphoglycerate mutase  42.11 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  0.436187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 		 203 aa  41.2  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>