52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4996 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  100 
 
 		 881 aa  1731    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  42.37 
 
 		 875 aa  555  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  35.4 
 
 		 880 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  28.26 
 
 		 880 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  28.49 
 
 		 878 aa  207  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  28.92 
 
 		 880 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  29.01 
 
 		 873 aa  173  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  27.73 
 
 		 875 aa  169  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  28.83 
 
 		 874 aa  159  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  27.78 
 
 		 875 aa  147  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  35.02 
 
 		 888 aa  127  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  32.2 
 
 		 878 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  35.48 
 
 		 874 aa  102  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  28.17 
 
 		 901 aa  96.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  40.65 
 
 		 870 aa  89.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  30.46 
 
 		 892 aa  85.5  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  25.67 
 
 		 883 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0995  DNA repair ATPase-like protein  25.48 
 
 		 910 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.923551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  28.14 
 
 		 877 aa  67.8  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  28.1 
 
 		 874 aa  63.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1160 aa  62  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  26.79 
 
 		 885 aa  61.6  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1185 aa  55.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  38.24 
 
 		 883 aa  53.9  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1051 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  28.87 
 
 		 1057 aa  53.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  34.78 
 
 		 968 aa  52  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2415  hypothetical protein  36.76 
 
 		 922 aa  52.4  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  25.57 
 
 		 875 aa  52  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  35.29 
 
 		 922 aa  51.6  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1348 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  28.26 
 
 		 955 aa  49.7  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  49.02 
 
 		 1511 aa  50.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  30.89 
 
 		 918 aa  48.5  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  48 
 
 		 1065 aa  47.8  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0399  chromosome segregation protein SMC  50.98 
 
 		 1165 aa  47.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.489923  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  28.28 
 
 		 917 aa  47  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1259  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1280 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1210 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1711  hypothetical protein  40.43 
 
 		 1180 aa  45.8  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0480  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1194 aa  46.2  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1284 aa  45.8  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1282 aa  45.8  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.37 
 
 		 626 aa  45.8  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4821  hypothetical protein  31.09 
 
 		 188 aa  45.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1270  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1181 aa  45.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3540  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1153 aa  45.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  38 
 
 		 712 aa  44.7  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1351 aa  44.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  30.69 
 
 		 1170 aa  44.7  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  30.69 
 
 		 1170 aa  44.7  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  30.88 
 
 		 664 aa  44.3  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>