71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4794 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  306  9e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  46.9 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  43.7 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  35.42 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3056  hypothetical protein  38.32 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  32.17 
 
 		 280 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  34.84 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  33.81 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  30.87 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  32.26 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  31.43 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  34.58 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  31.75 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  33.64 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  29.85 
 
 		 272 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  34.58 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  32.88 
 
 		 213 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  33.94 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  32.58 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  35 
 
 		 207 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  29.73 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  28.57 
 
 		 199 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  29.91 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  28.29 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  30.87 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  31.93 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  29.05 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  28.06 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  27.59 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  29.01 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  30.83 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  46.81 
 
 		 262 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  30.34 
 
 		 231 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  27.34 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  26.17 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6444  Protein of unknown function DUF2147  25.62 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  30.77 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  32.28 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  25.23 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  26.05 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  26.96 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  27.13 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  26.96 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  32.89 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  29.17 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  27.48 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  27.2 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  26.67 
 
 		 230 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  27.5 
 
 		 228 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  26.9 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  31.93 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  28.1 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  25.58 
 
 		 179 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  25.32 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  27.59 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  27.2 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  27.2 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  27.4 
 
 		 225 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  29.19 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  25.41 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  22.4 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  33.33 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0129  hypothetical protein  27.93 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.374028  normal  0.0265018 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  27.73 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  30.16 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  34.85 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  35.48 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  26.67 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  32.81 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  27.78 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>