More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1653 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1653  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0637812  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4236  alpha/beta hydrolase fold  53.39 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  25.39 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  32.58 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.28 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.97 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.49 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  28.87 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  24.71 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  24.71 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  27.05 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  24.71 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  27.53 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  29.37 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  34.11 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2065  magnesium chelatase accessory protein  38.14 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  24.62 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  41.11 
 
 		 293 aa  62  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 290 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  23.41 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  23.26 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  26.47 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  25.96 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  22.38 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  23.55 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1841  putative hydrolase protein  25.09 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.51 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  24.5 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  25.79 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  29.32 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2022  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560184  normal  0.215859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 		 338 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  24.11 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.97 
 
 		 639 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  36.08 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  26.18 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.61 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1918  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.683828  normal  0.386783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.4 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  20.77 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  27.41 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  28.16 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  25.54 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 		 396 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  23.83 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 361 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>