More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1841 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1841  putative hydrolase protein  100 
 
 		 295 aa  608  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2165  alpha/beta hydrolase fold  55.02 
 
 		 300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.26536  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0274  hypothetical protein  34.03 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2945  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  33.57 
 
 		 323 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1163  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  33.22 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2791  hypothetical protein  33.22 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.62 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  24.3 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.35 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  22.38 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  27.14 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.35 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  27.08 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.35 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  24.6 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  24.19 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  23.29 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  25.11 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.3 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  26.24 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  22.7 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  24.24 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  24.51 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1653  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0637812  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  26.88 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  24.12 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  24.8 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4362  alpha/beta hydrolase fold protein  29.38 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  23.65 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  25.59 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  23.14 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  23.14 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  23.14 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  23.74 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  23.14 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  28.76 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  20.08 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  22.39 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  22.53 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  23.14 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  23.34 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  22.85 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  23.34 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.24 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  22.82 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2564  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  24.26 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  23.14 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  22.94 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  25.47 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  23.08 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  22.38 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  25.64 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  21.4 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  23.94 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  27.42 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2156  alpha/beta family hydrolase  29.71 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  26.24 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>