68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2791 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2791  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2945  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  99.38 
 
 
323 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1163  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  100 
 
 
301 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0274  hypothetical protein  94.68 
 
 
301 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2165  alpha/beta hydrolase fold  33.55 
 
 
300 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.26536  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1841  putative hydrolase protein  33.22 
 
 
295 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.109154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.64 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
312 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.45 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.45 
 
 
343 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  23.46 
 
 
323 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0956  alpha/beta hydrolase fold  22.68 
 
 
337 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  33.09 
 
 
296 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 
366 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  23.96 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  21.68 
 
 
329 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  28.47 
 
 
356 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  24.58 
 
 
283 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  22.15 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  28.1 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.44 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  22.44 
 
 
296 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
262 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.24 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
321 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
288 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  23.66 
 
 
322 aa  47  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
294 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  21.19 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  24.17 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2535  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  25.81 
 
 
425 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  24.23 
 
 
304 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  22.33 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  23.96 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  23.7 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6084  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
278 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2088  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  23.7 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4087  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  27.27 
 
 
556 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779957  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0069  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2495  hydrolase, alpha/beta fold family  27.56 
 
 
293 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  25.98 
 
 
259 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  20 
 
 
324 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  21.22 
 
 
293 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  21.43 
 
 
304 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 
284 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  20.49 
 
 
335 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  26.64 
 
 
238 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 
286 aa  43.1  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  26.64 
 
 
251 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  26.64 
 
 
251 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
260 aa  42.7  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 
267 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 
292 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>