More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2165 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2165  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
300 aa  618  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.26536  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1841  putative hydrolase protein  55.02 
 
 
295 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.109154 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0274  hypothetical protein  33.99 
 
 
301 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2945  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  33.33 
 
 
323 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1163  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  33.55 
 
 
301 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2791  hypothetical protein  33.55 
 
 
323 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
315 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.26 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.26 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  22.06 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  22.95 
 
 
285 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  22.95 
 
 
285 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  23.63 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  22.53 
 
 
290 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
324 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  22.15 
 
 
302 aa  62.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 
295 aa  62.4  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  22.14 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  28 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  22.34 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  23.97 
 
 
301 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.41 
 
 
277 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 
283 aa  60.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  24.4 
 
 
298 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 
277 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
252 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 
280 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  20.68 
 
 
289 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1625  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  29.57 
 
 
288 aa  59.7  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.997053  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  23.59 
 
 
290 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 
350 aa  58.9  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
289 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  26.78 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  25.38 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  25.39 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  23.05 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
262 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 
329 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  25.58 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  25.58 
 
 
396 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  22.92 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 
290 aa  56.6  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
286 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  23.34 
 
 
275 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  25.49 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
292 aa  56.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.77 
 
 
277 aa  56.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  22.01 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  26.75 
 
 
268 aa  55.8  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 
312 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  20.15 
 
 
279 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  21.4 
 
 
291 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  20.52 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  24.33 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  20.52 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  20.52 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  20.52 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  28.92 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5558  alpha/beta hydrolase fold protein  26.99 
 
 
227 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  28.92 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44 
 
 
368 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  20.45 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44 
 
 
368 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44 
 
 
368 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 
271 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  20.32 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  24.05 
 
 
341 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  28.92 
 
 
256 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  19.85 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 
339 aa  53.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  22.54 
 
 
298 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.17 
 
 
370 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  23.36 
 
 
312 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  24.03 
 
 
377 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 
301 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
290 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 
332 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>