More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21800 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 552 aa  1080    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  66.79 
 
 		 518 aa  627  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  59.44 
 
 		 530 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  59.25 
 
 		 530 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  59.25 
 
 		 530 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  57.96 
 
 		 526 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  54.46 
 
 		 541 aa  495  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  57.17 
 
 		 534 aa  490  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  59.03 
 
 		 526 aa  485  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  56.29 
 
 		 520 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  53.94 
 
 		 546 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  50.46 
 
 		 553 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  52.51 
 
 		 548 aa  425  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  46.9 
 
 		 558 aa  421  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  48.53 
 
 		 521 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  48.35 
 
 		 551 aa  415  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  45.2 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  47.97 
 
 		 542 aa  405  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  47.6 
 
 		 539 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  48.85 
 
 		 498 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  50.28 
 
 		 547 aa  378  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  53.02 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  41.7 
 
 		 541 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  41.86 
 
 		 559 aa  345  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  43.05 
 
 		 563 aa  340  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  39.63 
 
 		 522 aa  275  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  31.78 
 
 		 520 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  34.51 
 
 		 540 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  26.47 
 
 		 505 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.91 
 
 		 583 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.56 
 
 		 553 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  32.83 
 
 		 539 aa  159  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  27.18 
 
 		 452 aa  156  9e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  28.38 
 
 		 546 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25.29 
 
 		 533 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  29.32 
 
 		 562 aa  155  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  31.16 
 
 		 540 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  24.56 
 
 		 574 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.81 
 
 		 543 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  29.5 
 
 		 527 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.84 
 
 		 560 aa  146  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.84 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  32.45 
 
 		 568 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.84 
 
 		 542 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  30.96 
 
 		 485 aa  144  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.06 
 
 		 530 aa  144  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  27.79 
 
 		 541 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  31.5 
 
 		 579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.48 
 
 		 556 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.57 
 
 		 543 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  27.34 
 
 		 543 aa  137  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31.73 
 
 		 522 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.4 
 
 		 544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  29.77 
 
 		 537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  24.76 
 
 		 539 aa  134  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  29.56 
 
 		 535 aa  133  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  25.88 
 
 		 550 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.63 
 
 		 565 aa  131  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  26.64 
 
 		 543 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 554 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  25.4 
 
 		 556 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.55 
 
 		 548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  30.88 
 
 		 549 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  29.58 
 
 		 551 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.41 
 
 		 583 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.01 
 
 		 556 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  31.8 
 
 		 544 aa  126  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.43 
 
 		 538 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  24.72 
 
 		 563 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 549 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.66 
 
 		 544 aa  124  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  25.85 
 
 		 553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  30.58 
 
 		 543 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.57 
 
 		 546 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  22.81 
 
 		 522 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  23.46 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  22.41 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  25.77 
 
 		 557 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  22.24 
 
 		 522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  21.84 
 
 		 522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  28.01 
 
 		 565 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.32 
 
 		 619 aa  117  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  27.99 
 
 		 547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  22.43 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  28.27 
 
 		 545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  29.38 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  33.76 
 
 		 536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  28.09 
 
 		 520 aa  115  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  24.04 
 
 		 552 aa  114  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  30.31 
 
 		 545 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  31.72 
 
 		 537 aa  114  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.97 
 
 		 540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.94 
 
 		 548 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  22.24 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  27.37 
 
 		 569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  22.05 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  22.05 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  31.93 
 
 		 536 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  24.74 
 
 		 557 aa  111  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  29.16 
 
 		 553 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>