More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05310 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 400 aa  768    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  55.22 
 
 		 435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  51.41 
 
 		 403 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  49.22 
 
 		 405 aa  332  8e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  45.45 
 
 		 440 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  51.54 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  50.38 
 
 		 401 aa  327  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 422 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 421 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  47.45 
 
 		 434 aa  295  8e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  45.1 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  47.07 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  42 
 
 		 431 aa  222  8e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 387 aa  102  8e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.02 
 
 		 409 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 395 aa  89.7  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 427 aa  88.2  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 405 aa  86.7  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.43 
 
 		 615 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 395 aa  86.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 504 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.67 
 
 		 540 aa  86.3  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.29 
 
 		 534 aa  84.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 		 512 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  24.34 
 
 		 685 aa  80.1  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.72 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  24.09 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  25.95 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  36.22 
 
 		 537 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.81 
 
 		 521 aa  79  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  28.25 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.12 
 
 		 555 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.29 
 
 		 509 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.66 
 
 		 514 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6409  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.62 
 
 		 578 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  23.19 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.25 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.25 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.29 
 
 		 918 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.86 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.81 
 
 		 528 aa  73.6  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 		 593 aa  73.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.68 
 
 		 523 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.93 
 
 		 525 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  34.32 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.37 
 
 		 493 aa  73.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.94 
 
 		 508 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.17 
 
 		 528 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.17 
 
 		 621 aa  73.2  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 		 646 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 		 609 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.01 
 
 		 537 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 		 646 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 		 646 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 539 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.07 
 
 		 539 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  33.94 
 
 		 683 aa  71.6  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  25.46 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 527 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 527 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  34.91 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 485 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0322  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.44 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 		 641 aa  70.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>