More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2712 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2712  luciferase family protein  100 
 
 		 388 aa  793    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.688075 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  27.22 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  26.94 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0838  amino acid adenylation domain-containing protein  29.05 
 
 		 1541 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2402  amino acid adenylation  26.05 
 
 		 1519 aa  77.4  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  25.45 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  25.16 
 
 		 3337 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  28.74 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.94 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  28.16 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2849  alkanal monooxygenase  28.63 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.633126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  24.37 
 
 		 4483 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  27.85 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1478  putative luciferase-alpha subunit  29.06 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4004  luciferase family protein  25.99 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  27.8 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  39.78 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  30.16 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  29.32 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  29.47 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  29.47 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  30 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3263  luciferase family protein  34.38 
 
 		 327 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  26.59 
 
 		 352 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  29.1 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  29.1 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  29.61 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  31.38 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  24.29 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0164  Luciferase-like monooxygenase  37.5 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0157  Luciferase-like monooxygenase  38.64 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.966319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  27.13 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  30.37 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  35 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  24.55 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  25.49 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  36.04 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6860  flavin-dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  26.65 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  40.23 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  31.07 
 
 		 346 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  24.04 
 
 		 6889 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1424  Luciferase-like monooxygenase  30.43 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3467  luciferase family protein  27.65 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  26.49 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  27.59 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  27.46 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  30.39 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  27.01 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  29.48 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3539  Luciferase-like monooxygenase  26.9 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  29.84 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  28.23 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03839  flavin dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  36.11 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  27.16 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3162  Luciferase-like monooxygenase  26.94 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  26.01 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11965  monooxygenase  24.02 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.234651  normal  0.884377 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  26.94 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2691  luciferase family oxidoreductase, group 1  26.07 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6195  luciferase family protein  36.67 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0105566 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1883  Luciferase-like monooxygenase  36.84 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.560845  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  24 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  27.62 
 
 		 361 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  21.23 
 
 		 364 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  26.35 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  24.79 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0210  luciferase family protein  25.65 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.370837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  25.09 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1960  Luciferase-like monooxygenase  24.38 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2321  monooxygenase, luciferase-like protein  24.38 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  24.78 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  27.94 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1412  flavin-dependent oxidoreductase  24.79 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0522  luciferase-like  23.53 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0804  putative luciferase-like monooxygenase  27.31 
 
 		 339 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  34.38 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1675  luciferase family protein  22.13 
 
 		 362 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.79214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3067  Luciferase-like monooxygenase  23.51 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  26.21 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1139  putative F420-dependent oxidoreductase  38.55 
 
 		 289 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2888  luciferase-like protein  29.46 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0852  luciferase family protein  33.64 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3246  Luciferase-like monooxygenase  36.46 
 
 		 342 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3576  luciferase-like monooxygenase  23.24 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138987  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0571  luciferase family protein  26.95 
 
 		 334 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  23.37 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4400  Luciferase-like monooxygenase  29.02 
 
 		 286 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  29 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  27.14 
 
 		 288 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  29.28 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1236  Alkanal monooxygenase (FMN-linked)  34.62 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.282844  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  24.12 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  40.91 
 
 		 324 aa  54.3  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  29.31 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  28.89 
 
 		 353 aa  53.5  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  31.91 
 
 		 345 aa  53.5  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>