285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2597 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13761  transferase  74.46 
 
 		 776 aa  810    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 523 aa  1077    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  93.31 
 
 		 530 aa  1016    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  43.38 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  39.62 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  38.61 
 
 		 471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  38.2 
 
 		 479 aa  299  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  34.5 
 
 		 463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  36.89 
 
 		 455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  36.62 
 
 		 481 aa  276  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  32.29 
 
 		 486 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  30.02 
 
 		 506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  31.61 
 
 		 459 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  32.33 
 
 		 727 aa  226  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  32.68 
 
 		 458 aa  224  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 		 467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  30.91 
 
 		 489 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 496 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  30.42 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  30.1 
 
 		 609 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  32.4 
 
 		 465 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  31.02 
 
 		 471 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 		 447 aa  212  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  30.04 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  29.64 
 
 		 578 aa  209  7e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 		 472 aa  209  8e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  29.98 
 
 		 487 aa  209  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  29.04 
 
 		 573 aa  209  9e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  27.66 
 
 		 495 aa  208  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  32.15 
 
 		 470 aa  207  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  27.98 
 
 		 561 aa  206  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  31.61 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 573 aa  204  3e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 		 519 aa  203  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  30.71 
 
 		 492 aa  203  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 		 569 aa  202  9e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 		 579 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  27.44 
 
 		 491 aa  199  9e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.43 
 
 		 495 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 		 559 aa  196  9e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  27.29 
 
 		 513 aa  195  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.13 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 581 aa  183  7e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 533 aa  182  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 608 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  38.28 
 
 		 588 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  27.68 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 		 514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  37.31 
 
 		 543 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 582 aa  167  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  26.33 
 
 		 706 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.32 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.75 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.8 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.24 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.29 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2160  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 		 322 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  26.38 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 359 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8971  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.26 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.89 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.81 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 316 aa  56.2  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  30.41 
 
 		 333 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.87 
 
 		 344 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4668  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.11 
 
 		 326 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0101  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.81 
 
 		 337 aa  55.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.012034  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 		 410 aa  56.2  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1320  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.01 
 
 		 327 aa  56.2  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 		 380 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  27.91 
 
 		 422 aa  54.7  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.35 
 
 		 399 aa  54.7  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4402  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.12 
 
 		 326 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320325  hitchhiker  0.00467523 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 394 aa  54.3  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.32 
 
 		 332 aa  53.5  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 317 aa  53.5  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 332 aa  53.5  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  22.69 
 
 		 415 aa  53.5  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0087  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.96 
 
 		 337 aa  53.5  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0823878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 377 aa  53.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 		 340 aa  53.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0378398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  21.03 
 
 		 327 aa  52.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>