195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2556 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3458  penicillin amidase  63.84 
 
 		 694 aa  788    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2745  penicillin amidase  86.47 
 
 		 692 aa  1070    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155883  decreased coverage  0.00157811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2556  penicillin amidase  100 
 
 		 702 aa  1363    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102799  normal  0.386886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3272  Penicillin amidase  49.79 
 
 		 698 aa  600  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0200  peptidase S45 penicillin amidase  43.36 
 
 		 742 aa  435  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1800  Penicillin amidase  42.1 
 
 		 739 aa  428  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.0000000164269  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  33.56 
 
 		 762 aa  328  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  31.48 
 
 		 761 aa  293  6e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5851  peptidase S45 penicillin amidase  31 
 
 		 724 aa  260  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390713  normal  0.0954334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  27.47 
 
 		 817 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  27.61 
 
 		 827 aa  197  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  29.89 
 
 		 770 aa  196  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  26.62 
 
 		 821 aa  191  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  29.7 
 
 		 829 aa  190  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  27.43 
 
 		 787 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  27.23 
 
 		 827 aa  188  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  26.26 
 
 		 804 aa  187  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  24.47 
 
 		 818 aa  187  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  26.72 
 
 		 821 aa  185  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  25.75 
 
 		 783 aa  181  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  26.44 
 
 		 779 aa  179  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  26.57 
 
 		 769 aa  176  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.09 
 
 		 796 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  24.94 
 
 		 819 aa  175  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  26.8 
 
 		 810 aa  174  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.19 
 
 		 796 aa  173  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  23.52 
 
 		 796 aa  173  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.73 
 
 		 796 aa  173  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  23.32 
 
 		 796 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  24.42 
 
 		 796 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  24.28 
 
 		 819 aa  172  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  28.81 
 
 		 813 aa  171  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.85 
 
 		 796 aa  171  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.28 
 
 		 796 aa  171  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.28 
 
 		 796 aa  171  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.49 
 
 		 796 aa  170  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  26.3 
 
 		 803 aa  168  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  29.91 
 
 		 809 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  30.09 
 
 		 809 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  29.23 
 
 		 818 aa  165  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  31.29 
 
 		 844 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  23.91 
 
 		 811 aa  161  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  25.35 
 
 		 848 aa  160  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0772  hypothetical protein  25.26 
 
 		 810 aa  159  1e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  25.28 
 
 		 847 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  25.25 
 
 		 847 aa  158  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  29.66 
 
 		 870 aa  153  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  32.03 
 
 		 864 aa  150  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0835  peptidase S45 penicillin amidase  30.83 
 
 		 856 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0497714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  28.6 
 
 		 857 aa  147  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1414  penicillin amidase  26.96 
 
 		 837 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  25.06 
 
 		 782 aa  145  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  25.76 
 
 		 823 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  29.05 
 
 		 858 aa  144  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  28.05 
 
 		 809 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  25.76 
 
 		 823 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  28.05 
 
 		 809 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1213  peptidase S45, penicillin amidase  24.61 
 
 		 816 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.951411 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  27.86 
 
 		 812 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  25.93 
 
 		 795 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  26.65 
 
 		 774 aa  139  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  26.84 
 
 		 821 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  28.07 
 
 		 854 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  28.37 
 
 		 855 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4002  penicillin amidase  27.85 
 
 		 818 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4305  penicillin amidase  32.68 
 
 		 641 aa  137  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104752  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1137  penicillin amidase  26.8 
 
 		 813 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.416343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  28.12 
 
 		 889 aa  137  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  24.48 
 
 		 824 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  23.58 
 
 		 823 aa  134  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  28.74 
 
 		 821 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4305  penicillin amidase  25.84 
 
 		 813 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  24.41 
 
 		 808 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  24.45 
 
 		 824 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  24.18 
 
 		 795 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  27.85 
 
 		 843 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  27.18 
 
 		 792 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  26.33 
 
 		 806 aa  130  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  27.32 
 
 		 903 aa  130  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  32.6 
 
 		 836 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  28.85 
 
 		 847 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  25.86 
 
 		 807 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  28.52 
 
 		 854 aa  128  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30580  penicilin amidase  29.28 
 
 		 898 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0787437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  25.03 
 
 		 827 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  25.59 
 
 		 780 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  24.28 
 
 		 829 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0950  peptidase S45 penicillin amidase  26.92 
 
 		 759 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.841423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0806  penicillin amidase family protein  26.92 
 
 		 802 aa  125  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1147  penicillin amidase  25.32 
 
 		 813 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.535161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1108  acylase  25.19 
 
 		 813 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77464  normal  0.714706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  29.86 
 
 		 872 aa  124  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  24.2 
 
 		 807 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  25.35 
 
 		 839 aa  123  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  27.18 
 
 		 789 aa  123  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  33.66 
 
 		 792 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  34.67 
 
 		 784 aa  120  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0953  peptidase  29.05 
 
 		 886 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4181  penicillin amidase  26.1 
 
 		 831 aa  120  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0631  penicillin amidase, putative  28.67 
 
 		 797 aa  118  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>