More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1988 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  72.22 
 
 		 138 aa  192  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  62.2 
 
 		 136 aa  160  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3754  NUDIX hydrolase  48.36 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3429  NUDIX hydrolase  48.74 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 		 122 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  29.57 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  32.03 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 473 aa  54.3  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 132 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  52.27 
 
 		 128 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 299 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  31.25 
 
 		 396 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  24.05 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  42.7 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 126 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 136 aa  50.8  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 138 aa  50.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 314 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0533  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0228598  normal  0.521082 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  27.19 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  25.58 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  45.33 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  22.07 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.2 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  30.77 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 		 324 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 102 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  29.73 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  54.17 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3008  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1920  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  30.71 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  33.61 
 
 		 365 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 199 aa  48.5  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  26.32 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 253 aa  48.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  50 
 
 		 139 aa  48.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 133 aa  48.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 209 aa  48.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  28.99 
 
 		 435 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3612  MutT/nudix family protein  36.92 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.463705  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1561  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  26.32 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  29.91 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  50 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 135 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  29.06 
 
 		 360 aa  47.8  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  26.32 
 
 		 153 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  28.14 
 
 		 187 aa  47.4  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  26.32 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  32.82 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  29 
 
 		 133 aa  47.8  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3111  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0922721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  26.32 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>