283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0069 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 221 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  80 
 
 		 221 aa  337  8e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  77.73 
 
 		 221 aa  336  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9419  hypothetical protein  59.53 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2736  ADP-ribose pyrophosphatase  36.77 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000235258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6422  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0866  NUDIX hydrolase  37.77 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0186051  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  65.96 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.54 
 
 		 362 aa  55.1  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  55.93 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  33.79 
 
 		 342 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 165 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  43.27 
 
 		 146 aa  52  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  46.88 
 
 		 148 aa  52.4  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.54 
 
 		 349 aa  52  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36 
 
 		 355 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  62.5 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  59.18 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 		 148 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 		 148 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  43.24 
 
 		 167 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 248 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 		 154 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 143 aa  49.3  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.15 
 
 		 345 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  65 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.46 
 
 		 159 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 149 aa  48.9  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 251 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 164 aa  48.5  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 170 aa  48.5  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 143 aa  48.5  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 		 147 aa  48.1  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  43.43 
 
 		 151 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 137 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 152 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 158 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 136 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  48.53 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 161 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  26.72 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  49.06 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  53.19 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  26.72 
 
 		 154 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  42.5 
 
 		 163 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  54.9 
 
 		 166 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.15 
 
 		 345 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  61.54 
 
 		 158 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  57.14 
 
 		 156 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 156 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4123  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 153 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  56.1 
 
 		 157 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  37.68 
 
 		 536 aa  45.8  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 144 aa  45.4  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 155 aa  45.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 155 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  60.61 
 
 		 132 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3717  cytidyltransferase-like protein  38.83 
 
 		 355 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  52.63 
 
 		 146 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.2 
 
 		 346 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  26.5 
 
 		 154 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 		 144 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.2 
 
 		 346 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 133 aa  45.4  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.2 
 
 		 346 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 		 165 aa  45.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.2 
 
 		 346 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.2 
 
 		 346 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 		 146 aa  45.4  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  60.61 
 
 		 132 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 146 aa  45.1  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.04 
 
 		 346 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 181 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 230 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 160 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  46.3 
 
 		 160 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  46.3 
 
 		 160 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  48.78 
 
 		 96 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  33.77 
 
 		 351 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  45.83 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 130 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  45.83 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>