222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0703 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0703  phytoene desaturase  100 
 
 		 453 aa  918    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.687275  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1073  phytoene dehydrogenase-related protein  58.87 
 
 		 460 aa  541  9.999999999999999e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  35.23 
 
 		 491 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  31.76 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  32.17 
 
 		 493 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  31.51 
 
 		 499 aa  224  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  31.72 
 
 		 490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  30.57 
 
 		 527 aa  215  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  29.22 
 
 		 497 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  28.68 
 
 		 519 aa  204  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  29.77 
 
 		 506 aa  204  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  29.96 
 
 		 500 aa  203  5e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  30.49 
 
 		 501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  30.34 
 
 		 490 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  28.07 
 
 		 488 aa  195  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  28.79 
 
 		 552 aa  193  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  30.08 
 
 		 536 aa  193  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  25.87 
 
 		 488 aa  192  9e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0318  phytoene desaturase  28.81 
 
 		 526 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158779  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  28.71 
 
 		 548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  26.78 
 
 		 566 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  29.88 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0409  phytoene dehydrogenase-related protein  28.33 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12770  phytoene desaturase  29.45 
 
 		 532 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  27.57 
 
 		 553 aa  166  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  27 
 
 		 525 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  27.87 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  26.64 
 
 		 542 aa  157  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  28.78 
 
 		 503 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  28.8 
 
 		 506 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  26.24 
 
 		 508 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  28.43 
 
 		 504 aa  153  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2891  phytoene desaturase  27.63 
 
 		 550 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.101189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  26.2 
 
 		 503 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  25.7 
 
 		 494 aa  150  6e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  26.11 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  27.49 
 
 		 505 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  25.93 
 
 		 492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  27.33 
 
 		 512 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  26.92 
 
 		 512 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  26.92 
 
 		 512 aa  146  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  28.19 
 
 		 502 aa  146  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  25.79 
 
 		 492 aa  146  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  26.04 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  26.42 
 
 		 507 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  27.61 
 
 		 509 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  23.94 
 
 		 504 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3491  phytoene desaturase  28.17 
 
 		 551 aa  139  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  26.35 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  26.07 
 
 		 531 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  25.45 
 
 		 502 aa  136  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  25.45 
 
 		 502 aa  136  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  26.9 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  25.16 
 
 		 529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  25.2 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  27.27 
 
 		 519 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  25.9 
 
 		 530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  25.9 
 
 		 530 aa  133  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0484  phytoene desaturase  25.2 
 
 		 493 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3760  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 		 524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  27.44 
 
 		 494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  25.45 
 
 		 504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  25.81 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  24.64 
 
 		 530 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  27.68 
 
 		 494 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  23.51 
 
 		 546 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.71 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  26.88 
 
 		 492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4005  FAD dependent oxidoreductase  23.97 
 
 		 516 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665607  hitchhiker  0.00234507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  25.51 
 
 		 493 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  25.39 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  26.22 
 
 		 511 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  25.39 
 
 		 512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0470  phytoene desaturase  26.4 
 
 		 496 aa  126  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  26.16 
 
 		 511 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  24.95 
 
 		 512 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  24.53 
 
 		 549 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  25.67 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  23.24 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  24.11 
 
 		 497 aa  124  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  26.01 
 
 		 511 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  26.11 
 
 		 507 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  24.34 
 
 		 553 aa  123  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  24.49 
 
 		 492 aa  123  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  27.49 
 
 		 495 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  24.74 
 
 		 508 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  24.8 
 
 		 519 aa  120  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  24.9 
 
 		 499 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  24.9 
 
 		 509 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  24.02 
 
 		 552 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  23.49 
 
 		 537 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  24.12 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  25.26 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  25.47 
 
 		 507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  24.95 
 
 		 508 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  23.34 
 
 		 516 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  25.06 
 
 		 495 aa  113  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  23.87 
 
 		 521 aa  112  9e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  23.54 
 
 		 519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  22.2 
 
 		 511 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>