150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1416 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  67.15 
 
 		 482 aa  671    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  100 
 
 		 493 aa  1020    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  66.12 
 
 		 491 aa  686    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  78.5 
 
 		 494 aa  775    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  63.69 
 
 		 488 aa  631  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  58.88 
 
 		 489 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  60.29 
 
 		 484 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  57.79 
 
 		 488 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  57.79 
 
 		 488 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  58.2 
 
 		 491 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  57.38 
 
 		 488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  58.2 
 
 		 491 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  58.2 
 
 		 491 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  55.03 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  60.76 
 
 		 451 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  33.97 
 
 		 486 aa  276  8e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  30.94 
 
 		 480 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  31.29 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  27.35 
 
 		 476 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  25.56 
 
 		 470 aa  159  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 790 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  30.7 
 
 		 546 aa  104  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  22.04 
 
 		 791 aa  103  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  23.4 
 
 		 824 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  22.87 
 
 		 790 aa  95.1  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  28.5 
 
 		 582 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  23.33 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  22.17 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  21.43 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  25.91 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  25.45 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  25.45 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  25.69 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  26.27 
 
 		 507 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  26.27 
 
 		 507 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1506  hypothetical protein  21.24 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107758  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  25.23 
 
 		 499 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  23.44 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  23.44 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  23.44 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  22.45 
 
 		 477 aa  67  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  22.97 
 
 		 274 aa  67  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  23.66 
 
 		 485 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  28.98 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  25 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  24.55 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  24.55 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  22.43 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  24.36 
 
 		 274 aa  63.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  24.11 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.6 
 
 		 290 aa  63.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 292 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  23.28 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  23.78 
 
 		 284 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  24.91 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  28.07 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  23.13 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  21.96 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  21.96 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  33.1 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.31 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  21.53 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  22.9 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  25.65 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 703 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  22.79 
 
 		 274 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  26.81 
 
 		 293 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 		 280 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  25 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  26.62 
 
 		 284 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  23.83 
 
 		 351 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 		 285 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1569  putative signal transduction protein  26.4 
 
 		 283 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  25.87 
 
 		 284 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 		 280 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  21.7 
 
 		 285 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2515  putative signal transduction protein  25.65 
 
 		 293 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  22.66 
 
 		 292 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  27.54 
 
 		 275 aa  54.7  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1582  thiamine-phosphate kinase  40.43 
 
 		 272 aa  54.7  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 		 427 aa  54.3  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  25.13 
 
 		 517 aa  53.9  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 280 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  22.8 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  23.71 
 
 		 285 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 		 287 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  24.74 
 
 		 297 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  24.64 
 
 		 352 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  24.03 
 
 		 716 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  23.28 
 
 		 281 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  25.45 
 
 		 297 aa  52.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 		 297 aa  52.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  24.29 
 
 		 353 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 		 298 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  23.26 
 
 		 274 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  21.96 
 
 		 277 aa  50.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  29.2 
 
 		 283 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  22.94 
 
 		 276 aa  50.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  23.19 
 
 		 284 aa  50.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  24.08 
 
 		 281 aa  50.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>