More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5159 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5159  octaprenyl-diphosphate synthase  100 
 
 
322 aa  622  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0320135  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  28.52 
 
 
322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  33.8 
 
 
333 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.16 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0352  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.7 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.9 
 
 
320 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  28.92 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.67 
 
 
320 aa  129  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.75 
 
 
335 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1084  polyprenyl synthetase  31.82 
 
 
326 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.64 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1465  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.38 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00436047  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1085  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.49 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.171148  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  34.32 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  35.5 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  35.18 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  37.28 
 
 
322 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  30.18 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  32 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  36.2 
 
 
323 aa  126  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  36.43 
 
 
322 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  31.32 
 
 
324 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51700  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  35.29 
 
 
311 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653243  hitchhiker  0.00209917 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  29.86 
 
 
326 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.47 
 
 
323 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  34.89 
 
 
322 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  29.47 
 
 
311 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  30.58 
 
 
324 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  34.89 
 
 
322 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.27 
 
 
326 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  34.89 
 
 
322 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  34.56 
 
 
322 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1389  polyprenyl synthetase family protein  31.46 
 
 
297 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0158  polyprenyl synthetase  37.22 
 
 
320 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  30.11 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  34.89 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.41 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  28.22 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  32.58 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  33.45 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  32.97 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  35.16 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  32.28 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  32.14 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  31.12 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  28.22 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0566  polyprenyl synthetase family protein  31.13 
 
 
297 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.293627  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.41 
 
 
323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  34.3 
 
 
322 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  33.82 
 
 
340 aa  119  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0645  polyprenyl synthetase family protein  30.79 
 
 
297 aa  119  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0989219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  24.19 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.61 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  33.09 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.34 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1738  polyprenyl synthetase family protein  28.84 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000413587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1254  Polyprenyl synthetase  31.54 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5924  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.41 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0223  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.31 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  34.11 
 
 
323 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  32.23 
 
 
323 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.44 
 
 
326 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  35.25 
 
 
335 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0208  trans-hexaprenyltranstransferase  35.74 
 
 
321 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647597  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0840  trans-hexaprenyltranstransferase  34.44 
 
 
327 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.24671  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  32.33 
 
 
331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  31.06 
 
 
322 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1998  polyprenyl synthetase  31.47 
 
 
292 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.553605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0752  trans-hexaprenyltranstransferase  32.33 
 
 
327 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0130726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.62 
 
 
322 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  35.69 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  33.6 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  39.15 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  34.72 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  31.51 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.86 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  33.76 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0190  prenyl transferase  27.89 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2490  Polyprenyl synthetase  35.98 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  35.21 
 
 
322 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  34.07 
 
 
336 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  28.66 
 
 
320 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  31.29 
 
 
322 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1784  polyprenyl synthetase  27.78 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.60288  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  33.01 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  34.74 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  33.21 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.64 
 
 
334 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  32.47 
 
 
318 aa  113  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1912  Polyprenyl synthetase  36.24 
 
 
321 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0763  prenyl transferase  38.46 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00222564  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.82 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3189  trans-hexaprenyltranstransferase  36.04 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  30.69 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.61 
 
 
333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0636  polyprenyl synthetase  40.5 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  33.69 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  32.16 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.04 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  31.48 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>