74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4405 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  61.9 
 
 		 189 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  60.85 
 
 		 189 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  52.88 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  49.48 
 
 		 190 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  49.47 
 
 		 190 aa  167  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  50.52 
 
 		 188 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  50.26 
 
 		 189 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  42.7 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  42.29 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  37.85 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 185 aa  98.2  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 183 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  32.45 
 
 		 185 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  32.45 
 
 		 182 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 182 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 182 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  31.38 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 285 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 249 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  36.54 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1631  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0987628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  32.35 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2597  hypothetical protein  31.25 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323808  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  31.78 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 259 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  32.41 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 238 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 343 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 258 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 211 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 194 aa  42  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 250 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 256 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 235 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 239 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  27.47 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 261 aa  41.6  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 250 aa  41.6  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 229 aa  41.2  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>