55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3356 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0490  transcriptional regulator  87.35 
 
 		 427 aa  784    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3992  transcriptional regulator, CadC  86.18 
 
 		 427 aa  783    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3867  transcriptional regulator, CadC  84.54 
 
 		 452 aa  769    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3356  transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 427 aa  890    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.36834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0499  transcriptional regulator  88.29 
 
 		 427 aa  788    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3532  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  87.82 
 
 		 427 aa  786    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0498  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  87.82 
 
 		 427 aa  782    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0503  transcriptional regulator, CadC  61.12 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0492  transcriptional regulator, CadC  59.95 
 
 		 427 aa  554  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0513  transcriptional regulator, CadC  58.31 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0358  transcriptional regulator, CadC  60.28 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0489  transcriptional regulator, CadC  57.85 
 
 		 427 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4446  transcriptional regulator, CadC  58.26 
 
 		 436 aa  529  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4467  transcriptional regulator, CadC  54.1 
 
 		 427 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4049  transcriptional regulator, CadC  32.4 
 
 		 413 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3465  DNA-binding winged-HTH domain-containing protein  28.6 
 
 		 435 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.817886 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0474  hypothetical protein  34.07 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01326  hypothetical protein  34.45 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4499  transcriptional regulator, CadC  43.28 
 
 		 711 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000101526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  35.65 
 
 		 292 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2882  transcriptional regulator, CadC  37.93 
 
 		 396 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.405219  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.97 
 
 		 229 aa  50.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0851  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 214 aa  49.7  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2791  transcriptional regulator domain-containing protein  35.23 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  35.63 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  31.11 
 
 		 522 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  31.54 
 
 		 493 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 493 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 493 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3769  transcriptional regulator, CadC  35 
 
 		 756 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0208668  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6027  transcriptional regulator, CadC  34.25 
 
 		 188 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0284754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4023  invasion protein regulator  38.24 
 
 		 565 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2749  putative transcriptional regulator, CadC  30 
 
 		 251 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0852  response regulator transcription regulator protein  40.7 
 
 		 246 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.650808  normal  0.373572 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  35.63 
 
 		 972 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4398  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.184239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3075  transcriptional regulator, CadC  33.33 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0940  transcriptional regulator domain protein  32.97 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000423424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  34.94 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0195  transcriptional regulator, CadC  34.74 
 
 		 277 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.8 
 
 		 228 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0706  transcriptional regulator, CadC  33.33 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303496  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2526  two component transcriptional regulator  32.98 
 
 		 262 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262723  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3144  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  36.25 
 
 		 317 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4280  transcriptional regulator domain-containing protein  28.89 
 
 		 531 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0505  cholera toxin transcriptional activator  40 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.26 
 
 		 217 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3981  two component transcriptional regulator  34.12 
 
 		 230 aa  43.5  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.53 
 
 		 223 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1276  transcriptional regulator domain-containing protein  32.98 
 
 		 499 aa  43.5  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5729  transcriptional regulator domain-containing protein  38.89 
 
 		 508 aa  43.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0851  two component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 		 261 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.0165752 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4688  DNA-binding transcriptional activator CadC  33.75 
 
 		 512 aa  43.1  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2466  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 235 aa  43.1  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.28267  hitchhiker  0.0000000000126243 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>