43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2749 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2749  putative transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0940  transcriptional regulator-related protein  50 
 
 		 247 aa  242  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3240  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  50.4 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3343  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  50.4 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0783  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  50.4 
 
 		 247 aa  238  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3632  response regulator receiver protein  47.47 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3438  winged helix family two component response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 250 aa  225  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0880  transcriptional regulator, CadC  46.4 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.102623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0883  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0760  response regulator receiver protein  43.96 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3653  transcriptional regulator, CadC  47.01 
 
 		 249 aa  204  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.409424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0833  transcriptional regulator, CadC  46.61 
 
 		 249 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3459  transcriptional regulator, CadC  46.61 
 
 		 249 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3534  transcriptional regulator, CadC  46.22 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0885  transcriptional regulator, CadC  43.7 
 
 		 246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0653  hypothetical protein  27.95 
 
 		 248 aa  86.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0879  hypothetical protein  26.05 
 
 		 248 aa  85.9  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0881  putative transcriptional regulator, CadC  28.52 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0936  transcriptional regulator  26.54 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3244  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0779  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3347  transcriptional regulator  25.1 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.730311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0757  putative transcriptional regulator, CadC  38.02 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.19634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3781  two component transcriptional regulator  36.05 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0240  two component transcriptional regulator  36.05 
 
 		 220 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000039366 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0241  two component transcriptional regulator  34.88 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3356  transcriptional regulator, CadC  30 
 
 		 427 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.36834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0358  transcriptional regulator, CadC  30.77 
 
 		 426 aa  45.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0793  putative transcriptional regulator, CadC  23.39 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.790637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4487  DNA-binding response regulator  34.88 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0287  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0271  winged helix family two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195642 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3532  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  30 
 
 		 427 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0499  transcriptional regulator  30 
 
 		 427 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0239  two component transcriptional regulator  33.72 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0498  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  30 
 
 		 427 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0357  two component transcriptional regulator  33.72 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0242  two component transcriptional regulator  33.72 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0239  two component transcriptional regulator  33.72 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4023  invasion protein regulator  34.72 
 
 		 565 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0245  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.72 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3992  transcriptional regulator, CadC  28.09 
 
 		 427 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0490  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 427 aa  42  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>