More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4398 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4398  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 263 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.184239 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3375  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.19 
 
 		 257 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2736  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.19 
 
 		 257 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00867541  hitchhiker  0.0000000494299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1263  two component transcriptional regulator  72.34 
 
 		 256 aa  361  8e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2789  winged helix family two component transcriptional regulator  73.25 
 
 		 256 aa  358  6e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0851  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.22 
 
 		 261 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.0165752 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0675  two component transcriptional regulator  63.49 
 
 		 252 aa  300  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal  0.0931169 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2466  two component transcriptional regulator  59.57 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.28267  hitchhiker  0.0000000000126243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 230 aa  161  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 233 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 237 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 229 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.42 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 240 aa  156  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.72 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 227 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 233 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  36.71 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  38.22 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1461  response regulator receiver  37.61 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000661728  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 231 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  37.97 
 
 		 237 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.15 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.08 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  36.29 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2015  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.94 
 
 		 239 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  36.71 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 235 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 231 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  35.44 
 
 		 237 aa  148  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  35.44 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  35.44 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 234 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  35.44 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  36.16 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0753  putative response regulator  39.65 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.77 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.94 
 
 		 231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  37.78 
 
 		 231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 234 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1230  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.71 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  36.94 
 
 		 231 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.4 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  35.93 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.27 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  36.32 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2502  two-component response regulator of kdp operon  40.64 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  38.57 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  38.57 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.82 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  34.18 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  34.05 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5840  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.99298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.64 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  38.91 
 
 		 234 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 232 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  38.12 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  38.12 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  34.6 
 
 		 238 aa  141  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  34.65 
 
 		 236 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.91 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  38.12 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.69 
 
 		 209 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>