More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2637 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.27 
 
 		 667 aa  837    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  79.01 
 
 		 667 aa  1031    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2976  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.61 
 
 		 667 aa  1136    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000241408  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.16 
 
 		 667 aa  1083    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.06 
 
 		 667 aa  1140    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.413203  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3134  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.06 
 
 		 667 aa  1141    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0135223  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3114  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.57 
 
 		 667 aa  854    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.76 
 
 		 667 aa  1140    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1568  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.57 
 
 		 667 aa  850    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2637  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 667 aa  1357    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295827  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.17 
 
 		 667 aa  819    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1243  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.16 
 
 		 667 aa  1083    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.16 
 
 		 667 aa  1081    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00146838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1146  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.89 
 
 		 668 aa  730    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.970933  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2345  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.16 
 
 		 666 aa  741    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60686 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002906  methyl-accepting chemotaxis protein  33.77 
 
 		 678 aa  363  8e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.816112  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.76 
 
 		 683 aa  348  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  31.96 
 
 		 658 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.31 
 
 		 658 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0210  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.67 
 
 		 632 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  normal  0.150257 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.25 
 
 		 646 aa  277  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00540264  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  30.91 
 
 		 658 aa  273  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0792  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.8 
 
 		 651 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3437  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.51 
 
 		 646 aa  253  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.143807  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.18 
 
 		 657 aa  251  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.068141  normal  0.373533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.62 
 
 		 672 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 		 660 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.229974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.02 
 
 		 659 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3594  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.34 
 
 		 646 aa  248  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.27 
 
 		 660 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0520721  normal  0.510764 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.27 
 
 		 660 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.78 
 
 		 660 aa  247  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4296  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.78 
 
 		 660 aa  247  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.08 
 
 		 656 aa  246  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.67 
 
 		 662 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.67 
 
 		 662 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  30.55 
 
 		 656 aa  241  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.92 
 
 		 680 aa  234  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.19 
 
 		 651 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1080  methyl-accepting chemotaxis protein  29.07 
 
 		 687 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.469209  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3136  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  29.26 
 
 		 661 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1684  methyl-accepting chemotaxis protein I  29.33 
 
 		 676 aa  229  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0994  methyl-accepting chemotaxis protein  29.83 
 
 		 678 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.799426  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.04 
 
 		 674 aa  227  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.06 
 
 		 643 aa  226  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0151066 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2308  methyl-accepting chemotaxis protein II  29.38 
 
 		 684 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.07 
 
 		 719 aa  223  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.78 
 
 		 651 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0837  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.01 
 
 		 680 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0272085 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0033  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.81 
 
 		 651 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250878  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01222  methyl-accepting chemotaxis protein  29.54 
 
 		 580 aa  210  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.566871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.57 
 
 		 674 aa  208  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.74 
 
 		 674 aa  209  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.61 
 
 		 677 aa  207  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.787316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  28.62 
 
 		 656 aa  206  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0140  putative methyl-accepting chemotaxis protein  29.33 
 
 		 684 aa  203  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0610174  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  32.19 
 
 		 627 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.81 
 
 		 626 aa  195  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  32.96 
 
 		 627 aa  194  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.9 
 
 		 630 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.34 
 
 		 639 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 		 630 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.71 
 
 		 630 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.71 
 
 		 630 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.78 
 
 		 548 aa  190  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  32.05 
 
 		 639 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 640 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.75 
 
 		 638 aa  188  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.7 
 
 		 773 aa  187  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.3 
 
 		 627 aa  187  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  29.67 
 
 		 630 aa  187  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  35.37 
 
 		 546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.98 
 
 		 540 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.11332 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0507  methyl-accepting chemotaxis protein  26.86 
 
 		 630 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 632 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 629 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.36 
 
 		 621 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.37 
 
 		 542 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.13 
 
 		 630 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.25 
 
 		 686 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.22 
 
 		 630 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 		 634 aa  183  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 		 555 aa  183  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.55 
 
 		 543 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.47 
 
 		 638 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.26 
 
 		 541 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.95 
 
 		 636 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  32.5 
 
 		 623 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.8 
 
 		 626 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 		 622 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.41 
 
 		 640 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.22 
 
 		 630 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  32.03 
 
 		 549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.47 
 
 		 638 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  33.76 
 
 		 652 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  34.65 
 
 		 568 aa  181  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 		 646 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 497 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 		 541 aa  180  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  29.31 
 
 		 626 aa  180  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>