196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0903 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0903  dienelactone hydrolase  100 
 
 
245 aa  511  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.833449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3630  dienelactone hydrolase  93.85 
 
 
245 aa  480  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3507  dienelactone hydrolase  93.85 
 
 
245 aa  480  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0857  dienelactone hydrolase  93.85 
 
 
245 aa  480  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3435  dienelactone hydrolase  93.88 
 
 
245 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0806  dienelactone hydrolase  90.98 
 
 
245 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.248795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3320  dienelactone hydrolase  90.57 
 
 
245 aa  471  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3217  dienelactone hydrolase  90.16 
 
 
245 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0519  dienelactone hydrolase  79.59 
 
 
245 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0743  dienelactone hydrolase  77.05 
 
 
245 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.774494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0826  dienelactone hydrolase  75.41 
 
 
245 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.390994 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0788  dienelactone hydrolase  75.41 
 
 
245 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237009  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0924  dienelactone hydrolase  74.18 
 
 
245 aa  387  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3046  dienelactone hydrolase  71.31 
 
 
245 aa  371  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.715018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2467  dienelactone hydrolase  68.98 
 
 
247 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4005  carboxymethylenebutenolidase family protein  68.44 
 
 
245 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  70.08 
 
 
245 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  67.62 
 
 
245 aa  358  5e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  65.16 
 
 
244 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0967  dienelactone hydrolase family protein  88.95 
 
 
172 aa  325  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  55.74 
 
 
244 aa  298  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3109  Carboxymethylenebutenolidase  51.23 
 
 
248 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  40.87 
 
 
269 aa  206  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0108419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  42.15 
 
 
248 aa  204  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  40.82 
 
 
245 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  41.22 
 
 
246 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  40.41 
 
 
246 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10652  dienelactone hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G07130)  43.1 
 
 
289 aa  190  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06410  carboxymethylenebutenolidase, putative  39.38 
 
 
275 aa  187  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  35.92 
 
 
246 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  35.77 
 
 
250 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0964  hypothetical protein  89.55 
 
 
68 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  28.75 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  29.63 
 
 
415 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  29.41 
 
 
409 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  28.87 
 
 
433 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  27.64 
 
 
248 aa  85.1  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  28.99 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  28.45 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  27.64 
 
 
247 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  27.69 
 
 
410 aa  78.6  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.64 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  24.78 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  28.63 
 
 
413 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  27.46 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  23.87 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  37.97 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  28.63 
 
 
413 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  27.92 
 
 
415 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  25.61 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  27.5 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  27.5 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  26.83 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  26.56 
 
 
407 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  27.2 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  26.56 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25.42 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  26.61 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  28.64 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  31.79 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  24.69 
 
 
232 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  27.07 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  27.71 
 
 
411 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  24.07 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0084  carboxymethylenebutenolidase  28.92 
 
 
275 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  31.13 
 
 
230 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  25.5 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  24.9 
 
 
248 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  24.9 
 
 
244 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2600  Carboxymethylenebutenolidase  28.1 
 
 
264 aa  58.9  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  25.46 
 
 
232 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  26.29 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  25.91 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  25.1 
 
 
297 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  29.8 
 
 
230 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  25.91 
 
 
248 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  28.39 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
295 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  24 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  25.62 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5204  dienelactone hydrolase  30.15 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1497  dienelactone hydrolase  24.66 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.184657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  24.46 
 
 
275 aa  52.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  24.9 
 
 
295 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  25.93 
 
 
229 aa  52.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4137  carboxymethylenebutenolidase  23.43 
 
 
298 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597321  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0145  dienelactone hydrolase  22.88 
 
 
288 aa  52  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  23.32 
 
 
232 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4163  dienelactone hydrolase  24.66 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2806  dienelactone hydrolase  22.82 
 
 
287 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0496759  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16031  dienelactone hydrolase  23.79 
 
 
238 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2950  Carboxymethylenebutenolidase  24.52 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  21.49 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1365  dienelactone hydrolase  24.62 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  23.28 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>