More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0111 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0111  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 320 aa  654    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.248059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4360  LysR family transcriptional regulator  94.97 
 
 		 318 aa  620  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4156  transcriptional regulator, LysR family  95.28 
 
 		 318 aa  623  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4228  LysR family transcriptional regulator  94.44 
 
 		 306 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2030  transcriptional regulator, LysR family  47.32 
 
 		 305 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2683  transcriptional regulator, LysR family  50.87 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2905  LysR family transcriptional regulator  50.87 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2818  LysR family substrate binding transcriptional regulator  50.87 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.987922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2945  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  46.26 
 
 		 300 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3131  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3339  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3390  transcriptional regulator, LysR family  45.8 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318019  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 307 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0828  LysR family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3662  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6979  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5329  LysR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 301 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0884153  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4957  LysR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 317 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3410  LysR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 317 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0692441  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1980  LysR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1558  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.14 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.525706  hitchhiker  0.00043239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1618  transcriptional regulator, LysR family  42.31 
 
 		 302 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3454  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4078  transcriptional regulator, LysR family  43.62 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0530  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546421  normal  0.717973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0721  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  0.129513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4379  LysR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3979  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3540  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5136  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2594  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  37.15 
 
 		 307 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0475  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5851  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3287  transcriptional regulator, LysR family  38.43 
 
 		 299 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0209  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 302 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2363  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4093  transcriptional regulator, LysR family  35.19 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  37.81 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3168  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1615  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86393  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0415  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10120  LysR family transcription regulator  38.81 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385324  normal  0.883998 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4162  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.711373 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2896  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5921  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 294 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 300 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 289 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4166  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 310 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  34.62 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43240  LysR family transcriptional regulator protein  34.46 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2922  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  36.08 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 295 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0707  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256747  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0915  transcriptional regulator, LysR family  39.15 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2545  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3170  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 303 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 316 aa  186  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2590  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 294 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1980  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 294 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 302 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1672  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3443  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.57 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2614  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  34.28 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>