More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3471 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  100 
 
 		 312 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  70.78 
 
 		 313 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  70.13 
 
 		 315 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  67.31 
 
 		 310 aa  421  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  64.95 
 
 		 311 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  68.44 
 
 		 325 aa  403  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  57.61 
 
 		 319 aa  348  7e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  53.53 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  54.58 
 
 		 316 aa  325  6e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  47.42 
 
 		 311 aa  301  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  45.13 
 
 		 314 aa  275  9e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  47.64 
 
 		 287 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  48.12 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  45.61 
 
 		 302 aa  252  7e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  42.71 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  47.44 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  44.03 
 
 		 295 aa  237  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  44.55 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  44.26 
 
 		 320 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3061  homocysteine S-methyltransferase  42.16 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30270  AdoMet-homocysteine methyltransferase  31.58 
 
 		 337 aa  142  5e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39914  predicted protein  32.49 
 
 		 418 aa  132  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0674804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  31.21 
 
 		 819 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  31.6 
 
 		 297 aa  106  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03378  homocysteine S-methyltransferase (Eurofung)  28.12 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  28.75 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  27.95 
 
 		 804 aa  96.3  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3407  homocysteine S-methyltransferase  25.76 
 
 		 358 aa  95.9  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174744  normal  0.0184405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  33 
 
 		 615 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  29 
 
 		 816 aa  94  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02520  homocysteine S-methyltransferase, putative  26.35 
 
 		 381 aa  93.2  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.54 
 
 		 605 aa  93.6  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.87 
 
 		 605 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  28.71 
 
 		 841 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  28.74 
 
 		 1236 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.45 
 
 		 610 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  25.37 
 
 		 1249 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0627  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.45 
 
 		 610 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.07944e-34 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  32.7 
 
 		 300 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  27.56 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  29.78 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  28.98 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  31.37 
 
 		 300 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  27.18 
 
 		 801 aa  89  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  28.53 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.02 
 
 		 609 aa  89  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  26.67 
 
 		 1225 aa  89  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  28.9 
 
 		 413 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  26.63 
 
 		 1232 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  30.07 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  26.1 
 
 		 1228 aa  87  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  26.92 
 
 		 768 aa  86.7  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  27.95 
 
 		 629 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02860  B12-dependent methionine synthase  27.19 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  26.92 
 
 		 768 aa  85.9  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  31.85 
 
 		 300 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2463  B12-dependent methionine synthase  27.19 
 
 		 1240 aa  85.9  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  30.41 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.43 
 
 		 604 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.537957  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  28.62 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1894  B12-dependent methionine synthase  26.35 
 
 		 1229 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  24.27 
 
 		 807 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  29.59 
 
 		 806 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  24.83 
 
 		 774 aa  84  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  31.85 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  28.72 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  25.23 
 
 		 1227 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  25.93 
 
 		 1224 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  28.47 
 
 		 804 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.19 
 
 		 605 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  27.68 
 
 		 818 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  27.95 
 
 		 804 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0892  homocysteine S-methyltransferase  23.87 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  28.57 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  28.4 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  23.87 
 
 		 780 aa  79  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  25.17 
 
 		 841 aa  79  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  28.71 
 
 		 800 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  24.46 
 
 		 1272 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2402  homocysteine S-methyltransferase  25.15 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264872  normal  0.0639264 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  23.51 
 
 		 793 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  28.29 
 
 		 813 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  27.06 
 
 		 1180 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  26.77 
 
 		 1244 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  28.19 
 
 		 811 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  26.82 
 
 		 804 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  25.15 
 
 		 1244 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3799  methionine synthase  24.38 
 
 		 1219 aa  76.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  25.15 
 
 		 1244 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  24.85 
 
 		 1244 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  26.71 
 
 		 1266 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  26.41 
 
 		 1247 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  26.63 
 
 		 1238 aa  75.1  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3207  methionine synthase (B12-dependent)  25.45 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  24.46 
 
 		 1271 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  25.23 
 
 		 1228 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  23.91 
 
 		 1230 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  24.37 
 
 		 1227 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  23.91 
 
 		 1230 aa  74.7  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  27.91 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0245772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>