154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0344 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  100 
 
 		 424 aa  874    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  34.94 
 
 		 414 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.35 
 
 		 726 aa  219  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  34.7 
 
 		 414 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  34.7 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.67 
 
 		 422 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.67 
 
 		 422 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.07 
 
 		 422 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  33.49 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  32.94 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.87 
 
 		 541 aa  174  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.46 
 
 		 412 aa  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  28.54 
 
 		 420 aa  153  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  30.67 
 
 		 410 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  30.1 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  28.84 
 
 		 1033 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  26.24 
 
 		 430 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  29.48 
 
 		 575 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.7 
 
 		 410 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  24.7 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.61 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.63 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  25.63 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  25.87 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  27.8 
 
 		 756 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  24.03 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  26.07 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  29.53 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  24.83 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  26.71 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  28.14 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  25.46 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  25.68 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  26.02 
 
 		 914 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.51 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  26.02 
 
 		 900 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  26.02 
 
 		 900 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  25.37 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  25.11 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3465  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.65 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  25.08 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  23.05 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.37 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  26.53 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  27.83 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  23.63 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.54 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.48 
 
 		 723 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6302  hypothetical protein  26.27 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  27.81 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0924  phosphoribosylamine--glycine ligase  24.74 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.39 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  22.77 
 
 		 453 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  22.77 
 
 		 453 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  23.83 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.57 
 
 		 425 aa  57  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.42 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  28.57 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03505  conserved hypothetical protein  31.96 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.31 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0646  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.43 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.41 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.7 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  24.63 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  24.63 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1295  phosphoribosylamine/glycine ligase  27.2 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.058661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.43 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.46 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.43 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  25.81 
 
 		 428 aa  53.9  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  23.08 
 
 		 412 aa  53.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  22.94 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  24.22 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  24.21 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  28.63 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  25.98 
 
 		 543 aa  51.2  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  24.29 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  23.44 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  24.57 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  22.43 
 
 		 321 aa  50.4  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.49 
 
 		 403 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.83 
 
 		 405 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0807  phosphoribosylamine/glycine ligase  26.84 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  26.7 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  28.22 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  25.74 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  22.65 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0813  phosphoribosylamine--glycine ligase  24 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.136066  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  23.47 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  25.52 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  23.88 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  24.5 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  25.52 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  25.52 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  22.77 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1353  phosphoribosylamine--glycine ligase  23.94 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  28.22 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  22.7 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1006  phosphoribosylamine--glycine ligase  24.86 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.283424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>