More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2664 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  77.3 
 
 		 392 aa  635    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 393 aa  806    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  76.79 
 
 		 392 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  72.47 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  72.22 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  71.97 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  71.72 
 
 		 397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  72.26 
 
 		 397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  73.51 
 
 		 391 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  72.34 
 
 		 397 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  72.34 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  72.08 
 
 		 397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  71.72 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  70.15 
 
 		 392 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  69.74 
 
 		 390 aa  565  1e-160  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  70.36 
 
 		 394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  62.72 
 
 		 413 aa  501  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  55.24 
 
 		 392 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  51.93 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  50.91 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  51.41 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  48.97 
 
 		 401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  48.84 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  48.33 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  48.72 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  48.33 
 
 		 392 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  48.59 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  48.84 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  48.84 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  48.84 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  48.7 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  48.59 
 
 		 391 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  48.59 
 
 		 391 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  48.33 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  48.33 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  47.53 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  49.6 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  47.53 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  47.57 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  46.02 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  46.37 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  45.29 
 
 		 399 aa  359  6e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  48.28 
 
 		 394 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  44.9 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.33 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.33 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  46.1 
 
 		 407 aa  347  3e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  45.34 
 
 		 418 aa  346  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.49 
 
 		 393 aa  345  6e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  45.13 
 
 		 391 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  44.19 
 
 		 386 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  44.19 
 
 		 386 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  42.56 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  43.93 
 
 		 386 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  45.19 
 
 		 400 aa  338  8e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  44.1 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  45.08 
 
 		 379 aa  337  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  42.38 
 
 		 392 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  41.65 
 
 		 414 aa  334  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.08 
 
 		 389 aa  333  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  43.78 
 
 		 398 aa  332  9e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  44.68 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  43.52 
 
 		 386 aa  331  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  40.72 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  44.5 
 
 		 398 aa  330  3e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  43.25 
 
 		 388 aa  329  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.64 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  44.3 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  40.67 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.62 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.03 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  41.84 
 
 		 396 aa  325  8.000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  45.53 
 
 		 381 aa  325  9e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  44.79 
 
 		 377 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  43.93 
 
 		 378 aa  323  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  42.42 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  44.79 
 
 		 377 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.97 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.49 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  43.23 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  44.53 
 
 		 377 aa  322  8e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  43.86 
 
 		 378 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  44.53 
 
 		 377 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.54 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  44.82 
 
 		 383 aa  321  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  44.53 
 
 		 377 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.28 
 
 		 407 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.32 
 
 		 392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  44.53 
 
 		 377 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  44.53 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  42.38 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  44.53 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  44.53 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  44.53 
 
 		 377 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  43.54 
 
 		 394 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.75 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  44.01 
 
 		 377 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.97 
 
 		 408 aa  319  7e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  44.19 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.08 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>