161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5904 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
231 aa  458  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  67.52 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  53.99 
 
 
217 aa  198  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  61.54 
 
 
225 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  62.42 
 
 
212 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4788  beta-Ig-H3/fasciclin  46.4 
 
 
222 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  54.22 
 
 
222 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  47.8 
 
 
216 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0328  beta-Ig-H3/fasciclin  51.18 
 
 
233 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12888  cell surface lipoprotein mpt83 (lipoprotein P23)  52.32 
 
 
220 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3760  beta-Ig-H3/fasciclin  49.08 
 
 
227 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.812819  normal  0.0116816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  41.03 
 
 
235 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  47.9 
 
 
193 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2259  beta-Ig-H3/fasciclin  48.8 
 
 
227 aa  135  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646176  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4084  beta-Ig-H3/fasciclin  49.4 
 
 
227 aa  135  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0159  beta-Ig-H3/fasciclin  48.77 
 
 
226 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2284  beta-Ig-H3/fasciclin  48.77 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000481809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2040  beta-Ig-H3/fasciclin  49.7 
 
 
197 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2086  beta-Ig-H3/fasciclin  49.7 
 
 
197 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  0.504905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2023  beta-Ig-H3/fasciclin  49.7 
 
 
197 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.113432 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4085  beta-Ig-H3/fasciclin  50.99 
 
 
194 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2547  beta-Ig-H3/fasciclin  46.3 
 
 
224 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0457535  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2041  beta-Ig-H3/fasciclin  45.78 
 
 
240 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2087  beta-Ig-H3/fasciclin  45.78 
 
 
240 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  0.529139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2024  beta-Ig-H3/fasciclin  45.78 
 
 
240 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2258  beta-Ig-H3/fasciclin  48.78 
 
 
194 aa  121  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4787  beta-Ig-H3/fasciclin  42.07 
 
 
218 aa  118  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0736899  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  42.59 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  41.26 
 
 
167 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2081  beta-Ig-H3/fasciclin  38.31 
 
 
199 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  42.58 
 
 
169 aa  97.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  39.69 
 
 
164 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4586  beta-Ig-H3/fasciclin  37.65 
 
 
273 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142813  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  41.54 
 
 
596 aa  92  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2119  beta-Ig-H3/fasciclin  36.88 
 
 
247 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  41.55 
 
 
166 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.86 
 
 
261 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  42.11 
 
 
161 aa  86.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  38.78 
 
 
160 aa  86.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  43.08 
 
 
134 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  38.46 
 
 
187 aa  85.5  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  41.61 
 
 
161 aa  85.1  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  42.62 
 
 
163 aa  85.1  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.62 
 
 
141 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  42.62 
 
 
163 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  38.75 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  39.72 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  38.75 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  40.15 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  40.15 
 
 
160 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  40.43 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  37.69 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  40.32 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  38.93 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.57 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  42.47 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4077  beta-Ig-H3/fasciclin  34.55 
 
 
247 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4153  beta-Ig-H3/fasciclin  34.55 
 
 
247 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4307  beta-Ig-H3/fasciclin  34.55 
 
 
247 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615408  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.59 
 
 
139 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 
178 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  37.3 
 
 
191 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  37.14 
 
 
186 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  43.31 
 
 
611 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  37.59 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  36.09 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  32.73 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  35.71 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  37.31 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  31.13 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  37.14 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  36.51 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  37.14 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  38.57 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  34.29 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  37.12 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  36.43 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  36.22 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  39.57 
 
 
168 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  35.34 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.82 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  40.44 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  39.71 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  39.72 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  36.67 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  36.67 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  33.83 
 
 
238 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  37.14 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  37.59 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  38.06 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.54 
 
 
133 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  37.24 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  37.59 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  37.04 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.81 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  36.88 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  37.9 
 
 
160 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  34.33 
 
 
134 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2962  secreted and surface protein  29.29 
 
 
140 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>