More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2522 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 148 aa  300  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 140 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  41.55 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 214 aa  117  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  42.75 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  39.82 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  34.65 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  41.82 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  28.8 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 147 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  32.67 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  27.01 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  31.48 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 169 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3121  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  33.71 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  29.31 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  29.31 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  32.65 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2005  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  52.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>