More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0676 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  61.26 
 
 
573 aa  723    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  61.5 
 
 
573 aa  721    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  100 
 
 
573 aa  1137    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.35 
 
 
573 aa  563  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.76 
 
 
568 aa  402  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  34.99 
 
 
579 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  34.68 
 
 
574 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.31 
 
 
580 aa  372  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  32.8 
 
 
581 aa  343  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.5 
 
 
603 aa  340  5e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
579 aa  339  8e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  35.88 
 
 
578 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  32.92 
 
 
1228 aa  333  7.000000000000001e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  32.81 
 
 
581 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  31.35 
 
 
588 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  35.36 
 
 
577 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  35.36 
 
 
577 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  33.02 
 
 
577 aa  292  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.05 
 
 
593 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.17 
 
 
577 aa  291  3e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  33.61 
 
 
597 aa  290  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.24 
 
 
588 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  29.53 
 
 
593 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.06 
 
 
577 aa  283  4.0000000000000003e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.48 
 
 
581 aa  283  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.04 
 
 
574 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.85 
 
 
581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  32.3 
 
 
578 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  32.2 
 
 
604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  32.3 
 
 
578 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  28.54 
 
 
607 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  31.6 
 
 
587 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  31.6 
 
 
587 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  35.95 
 
 
592 aa  272  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  34.23 
 
 
611 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  30.18 
 
 
606 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.54 
 
 
575 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  28.12 
 
 
587 aa  271  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.17 
 
 
581 aa  270  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  32.94 
 
 
579 aa  269  8.999999999999999e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  29.88 
 
 
576 aa  266  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.67 
 
 
593 aa  265  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.66 
 
 
572 aa  264  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  34.45 
 
 
599 aa  264  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  31.73 
 
 
616 aa  263  4.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.16 
 
 
573 aa  263  6.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  35.92 
 
 
588 aa  261  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  31.44 
 
 
571 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.59 
 
 
572 aa  260  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  29.67 
 
 
577 aa  259  7e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.35 
 
 
582 aa  259  9e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  29.36 
 
 
583 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.6 
 
 
583 aa  257  4e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  31.16 
 
 
598 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  31.78 
 
 
595 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  31.61 
 
 
593 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.94 
 
 
578 aa  254  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.09 
 
 
1091 aa  254  4.0000000000000004e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  29.05 
 
 
584 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.47 
 
 
579 aa  253  5.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  31.46 
 
 
595 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  30.85 
 
 
598 aa  253  9.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  30.58 
 
 
581 aa  252  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.9 
 
 
585 aa  252  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.66 
 
 
580 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  31.38 
 
 
565 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.18 
 
 
581 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  35.44 
 
 
589 aa  251  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  33.08 
 
 
584 aa  251  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.9 
 
 
586 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.9 
 
 
586 aa  250  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  30.41 
 
 
595 aa  250  5e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  29.2 
 
 
600 aa  250  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  30.2 
 
 
587 aa  250  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.71 
 
 
586 aa  250  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.71 
 
 
586 aa  250  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  33.4 
 
 
572 aa  250  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.8 
 
 
556 aa  249  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.52 
 
 
586 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.18 
 
 
596 aa  249  8e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  31.19 
 
 
600 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.2 
 
 
581 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  33.52 
 
 
586 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  29.57 
 
 
600 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.52 
 
 
586 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.4 
 
 
597 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  33.46 
 
 
574 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  27.89 
 
 
588 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 
586 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.2 
 
 
597 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  32.37 
 
 
550 aa  248  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.57 
 
 
617 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  33.86 
 
 
594 aa  248  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.81 
 
 
590 aa  247  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  29.81 
 
 
590 aa  247  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  30.97 
 
 
572 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  33.33 
 
 
603 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  45.82 
 
 
576 aa  246  6e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  32.85 
 
 
603 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.77 
 
 
589 aa  246  6.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>