More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3434 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3434  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
203 aa  387  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0945  lysine exporter protein LysE/YggA  60.1 
 
 
203 aa  238  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4806  lysine exporter protein LysE/YggA  64.02 
 
 
203 aa  237  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135415  normal  0.130992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4152  lysine exporter protein LysE/YggA  60.85 
 
 
203 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3016  lysine exporter protein LysE/YggA  56.1 
 
 
205 aa  216  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4677  lysine exporter protein LysE/YggA  60.32 
 
 
203 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3363  lysine exporter protein LysE/YggA  62.18 
 
 
203 aa  211  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0656798  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0186  amino acid transporter LysE  50.79 
 
 
205 aa  204  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1208  LysE family translocator protein  58.54 
 
 
233 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.905359  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0621  LysE family protein  58.54 
 
 
217 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1358  LysE family protein  58.54 
 
 
203 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0949  LysE family protein  58.54 
 
 
203 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2472  LysE family protein  58.54 
 
 
203 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.082911  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0342  LysE family protein  58.54 
 
 
203 aa  168  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1281  LysE family translocator protein  58.54 
 
 
203 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18583  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.39 
 
 
205 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.791137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4606  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.9 
 
 
242 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.118982 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0365  RhtB family transporter  45.37 
 
 
205 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3890  lysine exporter protein (LysE/YggA)  62.9 
 
 
137 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503752  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.41 
 
 
203 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0005  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.3 
 
 
203 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4540  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.26 
 
 
205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529468  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3100  lysine exporter protein LysE/YggA  44.07 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3492  lysine exporter protein LysE/YggA  35.45 
 
 
206 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724976  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1525  transporter, putative  60 
 
 
173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1173  lysine exporter protein LysE/YggA  37.68 
 
 
206 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.813849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2432  RhtB family transporter  30.2 
 
 
207 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.274649  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2130  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000391872  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2151  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.17 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2754  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  0.0643821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3827  lysine exporter protein (LysE/YggA)  63.38 
 
 
93 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000227303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  29.51 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0010  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 
207 aa  87.8  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.803659 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  29.74 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  29.35 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
208 aa  84.7  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1305  lysine exporter protein LysE/YggA  30.21 
 
 
204 aa  82  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4405  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.16 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  29.29 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  31.53 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.12 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.65 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  29.8 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.11 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  28.79 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0452  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  31.72 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1350  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.85 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641415  normal  0.0201928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  34.64 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6435  lysine exporter protein LysE/YggA  30.24 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  34.19 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.22 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0412  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.77 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.68 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.22 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  33.55 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.91 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.912842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4074  RhtB family transporter  39.84 
 
 
215 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.472652  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.99 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  28.26 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3365  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  29.24 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.77 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  28.02 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.9 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  31.41 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  28.36 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  27.72 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  28.26 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  28.26 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  30.54 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  29.57 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  27.36 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.53 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  25.44 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.24 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1421  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2255  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.674089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  34.06 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  25.44 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  32.37 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  28.71 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5273  lysine exporter protein LysE/YggA  29.41 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3652  amino acid transporter LysE  30.5 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.52 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2818  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2465  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.19798  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3214  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.29 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  30.82 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.66 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0856  lysine exporter protein LysE/YggA  34.31 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.985682  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  31.36 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3921  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>