More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3335 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  83.17 
 
 		 425 aa  737    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  82.2 
 
 		 425 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 429 aa  885    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  72.13 
 
 		 421 aa  627  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  45.6 
 
 		 442 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  42.92 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  40.19 
 
 		 431 aa  293  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  39.26 
 
 		 431 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07156  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00560)  40.28 
 
 		 427 aa  283  6.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0588  oxidoreductase domain protein  39.82 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568177  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2033  oxidoreductase domain protein  40.46 
 
 		 435 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  39.81 
 
 		 444 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 467 aa  257  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  38.41 
 
 		 495 aa  256  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3139  oxidoreductase domain protein  38.24 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.675334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  37.89 
 
 		 474 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  35.07 
 
 		 455 aa  244  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2657  Oxidoreductase domain protein  40.53 
 
 		 500 aa  242  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  35.78 
 
 		 493 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  37.07 
 
 		 450 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5530  oxidoreductase domain protein  40.43 
 
 		 411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  35.71 
 
 		 427 aa  189  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0398  oxidoreductase domain-containing protein  27.06 
 
 		 421 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1637  oxidoreductase, streptomycin biosynthesis protein (strI-related protein)  25.87 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.894895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1902  oxidoreductase family protein  25.87 
 
 		 421 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.171603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5135  oxidoreductase domain-containing protein  28.32 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04200  predicted dehydrogenase  26.82 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0431  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2126  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 397 aa  110  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  29.78 
 
 		 390 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0370  oxidoreductase domain protein  23.49 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5690  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  26.92 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2449  oxidoreductase domain-containing protein  25.59 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  23.53 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6634  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  24.71 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2163  oxidoreductase domain protein  28.16 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0615  oxidoreductase domain-containing protein  27.5 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.652806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4983  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.0480566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0594  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 		 399 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1658  oxidoreductase domain protein  38.62 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.526609  normal  0.191538 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  34.13 
 
 		 355 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4641  oxidoreductase domain-containing protein  25.41 
 
 		 386 aa  97.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.266729  normal  0.0830411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  24.46 
 
 		 699 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6237  oxidoreductase  24.58 
 
 		 393 aa  93.6  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0507772  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00810  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 		 420 aa  93.2  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.133238  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4990  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0959358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  26.39 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.59 
 
 		 362 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 360 aa  90.5  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 		 364 aa  90.5  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 		 360 aa  90.5  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  30.94 
 
 		 369 aa  90.1  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 347 aa  90.1  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  23.39 
 
 		 344 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.37 
 
 		 359 aa  87.4  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.37 
 
 		 359 aa  87.4  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  29.86 
 
 		 377 aa  87  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  31.68 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  36.67 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  32.83 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  35.14 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  28.96 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  32.18 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01870  streptomycin biosynthesis protein StrI, putative  24.08 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  31.4 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.64 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  32.9 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  28 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  29.14 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.64 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00380  predicted dehydrogenase  30.89 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  30.94 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  33.12 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  29.58 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  30.87 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  29.34 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  30.67 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2575  oxidoreductase domain-containing protein  23.47 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 		 330 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  29.76 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  22.6 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2670  oxidoreductase domain protein  27.59 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  27.45 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  31.36 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>