121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2102 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2102  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 395 aa  791    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2864  FAD dependent oxidoreductase  52.53 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.18748 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2901  sarcosine oxidase  52.66 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2604  FAD dependent oxidoreductase  51.01 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2865  FAD dependent oxidoreductase  48.86 
 
 		 397 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2605  FAD dependent oxidoreductase  47.85 
 
 		 395 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94246  predicted protein  28.64 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0800134  normal  0.0557343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0118  N-methyltryptophan oxidase  27 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2708  Sarcosine oxidase  24.75 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2212  N-methyltryptophan oxidase  25 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  0.375717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0149  Sarcosine oxidase  25.58 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3081  N-methyltryptophan oxidase  26.15 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0024  Sarcosine oxidase  26.96 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1272  N-methyltryptophan oxidase  25.34 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2028  N-methyltryptophan oxidase  25 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2926  N-methyltryptophan oxidase  26.68 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.793921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2497  N-methyltryptophan oxidase  24.81 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3311  N-methyltryptophan oxidase  27.44 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1257  N-methyltryptophan oxidase  23.71 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381174  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1228  N-methyltryptophan oxidase  24.64 
 
 		 372 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.431985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3327  sarcosine oxidase  26.32 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0248673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2484  N-methyltryptophan oxidase  25.1 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2632  Sarcosine oxidase  25.7 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3158  N-methyltryptophan oxidase  28.81 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00132325  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1573  N-methyltryptophan oxidase  23.71 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4751  N-methyltryptophan oxidase  26.58 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0979372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2285  N-methyltryptophan oxidase  24.29 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2460  N-methyltryptophan oxidase  24.55 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.580586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0471  N-methyltryptophan oxidase  26.55 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0768  N-methyltryptophan oxidase  26.55 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2505  N-methyltryptophan oxidase  24.55 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1323  Sarcosine oxidase  25.73 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1182  N-methyltryptophan oxidase  23.79 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.929893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1182  N-methyltryptophan oxidase  23.79 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2541  N-methyltryptophan oxidase  23.79 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.771923  normal  0.494055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0115  N-methyltryptophan oxidase  25.99 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01055  N-methyltryptophan oxidase, FAD-binding  23.37 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2587  Sarcosine oxidase  23.37 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01063  hypothetical protein  23.37 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2070  N-methyltryptophan oxidase  23.79 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384764  normal  0.194177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3166  N-methyltryptophan oxidase  24.8 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2677  N-methyltryptophan oxidase  26.82 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.895142 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2268  N-methyltryptophan oxidase  23.45 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1438  N-methyltryptophan oxidase  23.45 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.478275  normal  0.0445868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3520  Sarcosine oxidase  27.74 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1564  N-methyltryptophan oxidase  22.94 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1706  N-methyltryptophan oxidase  22.94 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0258535  hitchhiker  0.000102665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1672  N-methyltryptophan oxidase  22.94 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1596  Sarcosine oxidase  29.95 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1431  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0107924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  30.83 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0252  putative sarcosine oxidase  27.8 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3393  N-methyltryptophan oxidase  26.15 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6595  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.0778916 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1760  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.32 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2862  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  25.74 
 
 		 394 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0224  putative sarcosine oxidase  29.3 
 
 		 396 aa  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.44 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2073  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.568265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1892  N-methyltryptophan oxidase  22.51 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  hitchhiker  0.000636371 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  23.58 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  25.86 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  25.75 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  20.82 
 
 		 421 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  25.22 
 
 		 372 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.43 
 
 		 371 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2577  putative FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3838  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 		 827 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  25.32 
 
 		 371 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 436 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 436 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  25.43 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05050  conserved hypothetical protein  23.94 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2748  FAD dependent oxidoreductase  27.31 
 
 		 384 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0267692  normal  0.0112002 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  25.43 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0991  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.866144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3884  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  25 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  25.43 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  25 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  24.71 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3475  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4046  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5312  FAD dependent oxidoreductase  23.61 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2677  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0919  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 837 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 984 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>