More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6512 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 114 aa  228  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  58.33 
 
 		 124 aa  127  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  50.48 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  49.09 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  44.72 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  42.42 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  37.38 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  34.58 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  44.83 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 109 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  36.45 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  40.96 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  46.84 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  36.54 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  33.96 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  40.91 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  34.23 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 111 aa  62  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  33 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  35.92 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  35.35 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 372 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  37.65 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  34.83 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  40.79 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1435  PadR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.666797 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  36.63 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  33.96 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  36.79 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  34.15 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  37.25 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  36.79 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  39.77 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  30.48 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  39.77 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  39.77 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  30.56 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  39.77 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  30.56 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  31.48 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  39.77 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  34.09 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  43.24 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  34.07 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  36.19 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  30.48 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  35.71 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  30.48 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  30.48 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  36.46 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>