45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6431 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6431  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 325 aa  676    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0698  beta-glucanase precursor  45.53 
 
 		 369 aa  311  9e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0697  beta-glucanase precursor  43.92 
 
 		 381 aa  305  7e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1972  glycoside hydrolase family 43  39.56 
 
 		 501 aa  219  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  39.8 
 
 		 571 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  39.67 
 
 		 493 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  34.74 
 
 		 494 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  36.86 
 
 		 475 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0434  hypothetical protein  31.98 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4425  hypothetical protein  29.86 
 
 		 360 aa  165  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1520  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1278 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.334593  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02664  beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14190)  31.4 
 
 		 488 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  33.96 
 
 		 1197 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.647548 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34830  hypothetical protein  32.99 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  25.48 
 
 		 509 aa  62.8  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  29.6 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  27.75 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  31.16 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.78 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  27.36 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  28.91 
 
 		 533 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  25.75 
 
 		 348 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  25.81 
 
 		 530 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  25.86 
 
 		 324 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  24.2 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  24.84 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  26.29 
 
 		 524 aa  49.7  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  25.64 
 
 		 383 aa  49.7  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.19 
 
 		 444 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  24.54 
 
 		 319 aa  49.3  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  24.07 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  27.17 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  26.37 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  29.2 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  22.34 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  25.54 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  23.71 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  24.62 
 
 		 517 aa  46.6  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 		 644 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  24.07 
 
 		 1186 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  22.64 
 
 		 542 aa  43.5  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.38 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  24.83 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  22.27 
 
 		 523 aa  42.4  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>