More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2074 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2074  response regulator receiver protein  100 
 
 		 143 aa  296  9e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 		 355 aa  74.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  29.46 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5174  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  29.46 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 289 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  29.46 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 299 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  28.99 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0415  response regulator receiver domain-containing protein  29.51 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  29.29 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 523 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  30 
 
 		 1374 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0168  response regulator receiver protein  28.78 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  24.63 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  28.12 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  31.5 
 
 		 324 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  31.47 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 1349 aa  63.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2513  response regulator receiver protein  27.48 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  28.24 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  27.01 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  31.2 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  27.27 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  31.5 
 
 		 497 aa  62.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.25 
 
 		 1499 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  29.32 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  29.13 
 
 		 326 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2351  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1676  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 1141 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0847  two component diguanylate cyclase  29.37 
 
 		 327 aa  60.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  32 
 
 		 734 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 1143 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  27.07 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1145 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  34.23 
 
 		 313 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1037  sensory box/response regulator  30.71 
 
 		 799 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  29.13 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  29.13 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  29.13 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  29.13 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2679  response regulator receiver domain-containing protein  29.1 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.380915  normal  0.27601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  24.43 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  25.56 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 920 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 941 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2164  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  25.17 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  28.68 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  24.14 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  25.17 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  31.4 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1900  response regulator  27.54 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176755  normal  0.0491434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  33.05 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3598  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 911 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  28.24 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  31.54 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 		 1271 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  28.24 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1739  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0711596  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2346  histidine kinase  31.39 
 
 		 372 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 911 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  24.81 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  27.61 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  29.01 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  27.82 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 		 859 aa  57.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5579  response regulator receiver protein  26.12 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3419  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  26.92 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  26.12 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2574  response regulator  29.91 
 
 		 368 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1203  response regulator of chemotaxis  30.65 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.266578  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.46 
 
 		 434 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.46 
 
 		 434 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  23.61 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>