More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0484 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.53 
 
 		 254 aa  352  4e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  64.52 
 
 		 254 aa  332  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.4 
 
 		 250 aa  328  7e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.14 
 
 		 255 aa  326  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.51 
 
 		 250 aa  326  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62 
 
 		 254 aa  323  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.4 
 
 		 256 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.63 
 
 		 255 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.25 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.15 
 
 		 254 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.73 
 
 		 259 aa  316  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.94 
 
 		 251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.45 
 
 		 252 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.24 
 
 		 251 aa  306  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.64 
 
 		 259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.75 
 
 		 254 aa  305  7e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.4 
 
 		 251 aa  299  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62 
 
 		 253 aa  298  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.92 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.55 
 
 		 269 aa  297  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.8 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.6 
 
 		 253 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.06 
 
 		 254 aa  295  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 		 253 aa  295  6e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1730  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  61.57 
 
 		 256 aa  293  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.84 
 
 		 253 aa  293  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.96 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.02 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.01 
 
 		 269 aa  292  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167231  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.2 
 
 		 253 aa  291  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.8 
 
 		 253 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.4 
 
 		 251 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.75 
 
 		 252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.86 
 
 		 256 aa  280  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.65 
 
 		 253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.69 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  53.2 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.61 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  51 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.59 
 
 		 194 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000473762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.63 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 		 275 aa  242  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.21 
 
 		 262 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.15 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.282808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  47.74 
 
 		 247 aa  221  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3545  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 		 247 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.7 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  41.77 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  42.17 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  41.37 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  41.37 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  41.77 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  41.37 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  40.56 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 248 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  40.56 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 248 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 248 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 247 aa  178  9e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 253 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  39.76 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5176  short-chain dehydrogenase  41.77 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340709  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1224  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  37.35 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0621066  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.22 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.260797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>